A recent survey showed that only 10% of physicians thought they had the necessary training and knowledge in genomics to use genetic testing in treating patients.
Lancet Oncology 2005; 6(10):
Beverage JN et al. J Pharm Sci Sep;96(9):
To further explore the potential relationship between deficiencies in the CYP2D6 gene and outcomes achieved with tamoxifen among women with hormone-positive breast cancer, researchers from the Mayo Clinic conducted a retrospective analysis of a subgroup of patients from the Austrian Breast and Colorectal Study Group-8 (ABCSG-8) trial. The ABCSG-8 was a prospective clinical trial conducted between in which 3,901 women with hormone- positive breast cancer were randomized prior to treatment to two years of adjuvant tamoxifen followed by three years of Arimidex ® (anastrozole) or five years of adjuvant tamoxifen.
* At five years poor metabolizers who were randomized to tamoxifen had a 3.8- fold increased risk of recurrence compared with extensive metabolizers of tamoxifen. * However, poor metabolizers who were randomized to switch to Arimidex after two years of tamoxifen did not experience an increased recurrence risk at years three and five. The researchers concluded that these results provide further evidence that testing for CYP2D6 variances can help determine which patients may respond to tamoxifen and that testing prior to adjuvant therapy should be considered following discussion with the patient. Reference: Goetz M, Ames M, Gnant M et al. Pharmacogenetic (CYP2D6) and gene express profiles (HOXB13/IL17BR and molecular grade index) for prediction of adjuvant endocrine therapy benefit in the ABCSG 8 trial. Presented at the San Antonio Breast Cancer Symposium. December 13, Abstract 57
January 5, 2009 CYP2D6 Gene Variants May Affect Responses to Tamoxifen Among Breast Cancer Patients Among postmenopausal women with estrogen receptor-positive breast cancer, those with certain variations in the CYP2D6 gene derived little benefit from tamoxifen (Nolvadex®); based on these findings, researchers at the Mayo Clinic recommend CYP2D6 testing for postmenopausal women being considered for adjuvant tamoxifen therapy. These results were presented at the 2008 San Antonio Breast Cancer Symposium
Beverage JN et al. J Pharm Sci Sep;96(9):
CYP2C9 analysiert werden die SNPs „CYP2C9 Allel *2“ und „CYP2C9 Allel *3“ A. wenn ein SNP oder beide homozygot-mutiert vorliegen: PM B. wenn beide SNPs heterozygot (combound heterozygous) vorliegen:PM C.wenn nur einer der beiden SNPs heterozygot vorliegt: IM D.wenn beide SNPs homozygot-wildtyp vorliegen: EM CYP2C19 analysiert wird der SNP „ CYP2C19 Allel *2“ A. wenn der SNP homozygot-mutiert vorliegt: PM B.wenn der SNP heterozygot vorliegt: IM D.wenn der SNP homozygot-wildtyp vorliegtEM CYP2D6 analysiert werden die 3 SNPs „ CYP2D6 Allel *3, Allel *4 und Allel *6“ A. wenn ein SNP oder mehrere homozygot-mutiert vorliegen: PM B. wenn min. 2 SNPs heterozygot (combound heterozygous) vorliegen:PM C.wenn nur einer der 3 SNPs heterozygot vorliegt: IM D.wenn alle 3 SNPs homozygot-wildtyp vorliegen: EM
Polymorphe Pharmakokinetik von Antidepressiva
SAROTEN AMITRIPTYLIN (AT) AT NORTRYPTILIN CYP 2 C19 CYP 2 D 6 CYP 2 D6 POOR METABOLIZER (PM): 50% DER EMPFOHLENEN DOSIS CYP 2 D6 EXTENSIVE METABOLIZER (EM): 120% DER EMPFOHLENEN DOSIS
SAROTEN - Filmtabletten 10 mg DOSIERUNG Peroral ambulant: Initial mg abends NEBENWIRKUNGEN Anticholinerg, Kreislauf, Herz, Allergien, Knochenmark, Photosensibili- sierung, Ödem. WECHSELWIRKUNGEN Katecholamine, ZNS-Dämpfer, Alkohol, Anticholinergika, Antihistaminika verstärkt, MAO-Hemmer (Krisen), L-Dopa abgeschwächt. Kontrollen: Blutbild, Leber, Herz. MAO-Hemmer 14 Tage Abstand. Erhöhte Krampfbereitschaft bei Elektroschock. Umschlagen in manische Phase möglich. Vorsicht bei Suizidtendenz. Verkehrshinweis.
FLUOXETINE (FLU) FLU (RAC) NOR-FLU CYP 2D6 PM CYP 2D6 INITIALDOSIS 70% EM CYP 2D6 INITIALDOSIS 110% FLUCTIN
Renin-Angiotensin-Aldosteron-System Plasmavolumen Sympath. Nervensystem Blutdrucksenkung Natriumentzug EE/E2 ÖstrogeneCortisol, Cortison Glatte Gefäß- muskulatur - Vasokonstriktion - Blutdruckerhöhung Erhöhung der Nor- adrenalinfreisetzung Wirkung auf ZNS zentrale Blutdruckerhöhung Metabolische Effekte Leber Pro-Renin Renin Niere ACTH Angiotensinase DRSP/ Prog. Wasser- und Natriumretention Angiotensinogen Angiotensin I ACE II NebennierenrindeAldosteron
polymorphic 287 bp insertion/deletion sequence 5‘ 3‘ INTRON 16 of the ACE gene Angiotensin I-Converting Enzym (ACE) Polymorphism: Ins/Del (287bp) in Intron 16
SYMBOL rs NCBIPOLYMORPHISMUS ACE rs Ins/Del Intron 16 Das menschliche ACE-Gen besitzt einen bekannten Insertions/Deletions (I/D) Polymorphismus, dessen D/D Genoytp mit hohen Plamaspiegeln des Enzyms und damit verbundenen erhöhten Angiotensin II Konzentrationen assoziiert ist.
Rigat B et al. J Clin Invest Oct;86(4): Serum immunoreactive ACE concentrations (ag/liter) for individual with the II, ID, and DD genotypes, respectively, shown in left, middle, and right panels.
ANGIOTENSIN SYSTEM ACE SNP Aldosteron Renin Angiotensin 2 normale Ernährung: ug/24h salzarme Ernährung: ug/24h salzreiche Ernährung: ug/24h ALDU ng/ml*h (Liegen), ng/ml*h (Stehen) Salzarme Diät RENA Jahre : U/l Erwachsene (> 19 Jahre) : U/l ACE
Discussed at the moment is the question, whether drug response in men with erectile dysfunction is genetically determined. Only 50% of ACE D allele carriers showed a positive response to sildenafil in contrast to men with genotype II in the ACE I/D polymorphism, who had a response rate of 75%. (Herz Jun;28(4):304-13; Eisenhardt A
N Engl J Med Dec 18;359(25):
Scrivani SJ et al. N Engl J Med Dec 18;359(25): Normal Anatomy of the Jaw
Scrivani SJ et al. N Engl J Med Dec 18;359(25): Normal Jaw Function
Tempomandibuläres Syndrom Inzidenz Mann : Frau = 1: 9 ●Intraarticuläre Veränderung ●COMT L/L ●Niedriges Östradiol Lancet Oct 27;370(9597):
Kanasaki K et al. Nature Jun 19;453(7198): Epub 2008 May 11. Schematic illustration of 2-ME synthesis by COMT
Kanasaki K et al. Nature Jun 19;453(7198): Epub 2008 May 11. A working model of preeclampsia derived from our studies with COMT/2-ME Supplementary Figure 15
Präeklampsie Plazentare Östrogene ↓ 2-Methroxyöstradiol ↓ Hypoxie inducible Factor 1 Trophoblastinvasion in Spiralarterien
supprimiert Hypoxia inducible Factor 1 (HIF12) suluble Fms like Tyrosin Kinase 1 (= löslicher VEGF Receptor) 2 Methoxyöstradiol
COMTTOLCAPONE Synthese endogener Opiate Inaktivierung zentraler Catecholamine Reduktion der Schmerzempfindung SCHMERZEMPFINDUNG
In einer retrospektiven Studie konnte gezeigt werden, dass Patienten mit einer erniedrigten COMT-Aktivität häufiger einen Schock bei Bypassoperationen erleiden und ein höheres Sterblichkeitsrisiko während der Operation haben. Haase-Fielitz A, Haase M, Bellomo R, et al.: Decreased Catecholamine Degradation Associates with Shock and Kidney Injury after Cardiac Surgery, J Am Soc Nephrol Apr 30. SCHOCK
COMT met weist einen höheren Gewebsspiegel an Östrogen auf, wodurch die Lipoproteinlipase aktiviert wird.
N Engl J Med Mar 6;358(10):
WARFARIN BENÖTIGTE INDIVIDUALDOSIS KALIBIRIERT AN CYP 2C9 *1 CYP 2 C 9 1*/2* 80 % 2*/2* 20 % 1*/3* 56 % 2*/2* 23 % 3*/3* 9%
Kohnke H et al. Eur J Clin Pharmacol Jul;61(5-6): Epub 2005 Jun 11.
Neurology May 23;54(10):
Kein neuroprotektiver Effekt der Östrogene bei APO E4 Trägerinnen Yaffe K et al. Neurology 2000;54:
Yaffe K et al. Neurology May 23;54(10): Time to cognitive impairment (3MS score,80) according to APOE- 4 status and baseline estrogen use after adjusting for age, education, race, and stroke history
Yaffe K et al. Neurology May 23;54(10):
Progesteron 0,4 g Testosteron 500 µg Colecalciferol 2000 I.E. PEG 400 1,6 g PEG ,05 g M.u.f. Supp. XXIV
de Jong P. N Engl J Med 2006;355: Selected Candidate Genes Most Likely Associated with AMD
Age-Related Eye Disease Study Research Group. Arch Ophthalmol 2001;119: Vitamin C Vitamin E -Carotin Zinkoxid Kupferoxid 500 mg 400 mg 15 mg 80 mg 2 mg Erkrankungsreduktion in 5 Jahren um 25%
Seddon JM et al. Arch Ophthalmol Jul;124(7):
Genetische Variation und Fähigkeit zur Partnerschaft Molecular genetic studies of the arginine vasopressin 1a receptor (AVPR1a) and the oxytocin receptor (OXTR) in human behaviour: from autism to altruism with some notes in between. Israel S, Lerer E, Shalev I, Uzefovsky F, Reibold M, Bachner-Melman R, Granot R, Bornstein G, Knafo A, Yirmiya N, Ebstein RP. Prog Brain Res. 2008;170:
AVPR1 – Polymorphismus und Bindungsfähigkeit Proc Natl Acad Sci U S A Sep 16;105(37): Epub 2008 Sep 2.
SYMBOLrs NCBIPOLYMORPHISMUS F5rs6025Arg506Gln Das weithin bekannte F5 Leiden Allel codiert für eine Faktor V Variante, die nur ungenügend durch APC inaktiviert wird. Durch diesen Polymorphismus kann der Antagonist des Faktor V, nämlich das aktivierte Protein C nicht angreifen und die Prothrombinwirkung des Faktor V nicht ausbalancieren. Dies ist mit einer höheren Inzidenz thromboembolischer Ereignisse verbunden.
SYMBOLrs NCBIPOLYMORPHISMUS F2rs G/A Pos Das humane Prothrombin Gen, F2, besitzt einen selten vorkommenden Polymorphismus (G/A Pos ) innerhalb der 3’-untranslatierten Region, der zu erhöhten Serum Prothrombin - Spiegeln und somit zu einer erhöhten Gerinnbarkeit des Blutes führt.
SYMBOL rs NCBI POLYMORPHISMUS APOE rs Cys112Arg APOE rs7412 Arg158Cys Das APOE-Protein besteht aus 299 Aminosäuren mit einer wichtigen Bindungsstelle zwischen den Aminosäuren 140 und 160. Das auf Chromosom 19 lokalisierte ApoE-Gen kommt in drei bekannten Allelvarianten (e2, e3 und e4) vor, die wiederum drei Isoformen des Proteins bilden: E2, E3 und E4. APOE3 ist die häufigste Isoform und besitzt ein Cystein in Aminosäure Position 112 und innerhalb der Bindungsregion ein Arginin in Aminosäure Position 158. APOE4 besitzt ein Arginin an Stelle 112 und hat normale Bindungskapazität. APOE2 trägt ein Cystein in der Bindungsregion an Stelle 158 und zeigt nur 1-2 % der normalen Bindungskapazität
SYMBOLrs NCBI POLYMORPHISMUS PAI1 n.a. 5G/4G Promoter Die Trägerschaft des 4G – Allels ist mit erhöhtem PAI-1 Plasmaspiegel assoziiert.
SYMBOL rs NCBIPOLYMORPHISMUS NOS3rs Glu298Asp NOS3rs T/C Pos Promoter Vor allem zwei Polymorphismen, gehen mit einer reduzierten eNOS Aktivität einher, der Glu298Asp Polymorphismus, sowie der T/C Pos.-786 Promotorpolymorphismus.
SYMBOLrs NCBIPOLYMORPHISM MTHFRrs Ala222Val (C/T Pos.677) Der C > T Austausch in der Pos. 677 im MTHFR Gen führt zum Aminsäureaustausch Alanin nach Valin. Die Valin-Variante ist mit reduzierter Enzymaktivität und einem moderat erhöhten Homcysteinspiegel verbunden. Homozygote Träger des T-Allels (T/T) haben ein um ca. 25 % höheres tHcy im Vergleich zu homozygoten C-Trägern (C/C).
SYMBOLrs NCBI POLYMORPHISMUS COMTrs4680Val158Met Der sicher am häufigsten untersuchte Polymorphismus im COMT Gen ist die Val158Met Variante (manchmal auch Val>Met Codon 108 genannt). Dieser Basenaustausch ist mit verringerter Enzymaktivität und herabgesetztem Abbau von Östrogenen und anderen Katechol-Verbindungen assoziiert.
SYMBOL rs NCBI POLYMORPHISMUS VDRrs VDR FokI f/F (T/C) FokI polymorphism Dieser Polymorphismus führt zur Bildung von zwei unterschiedlichen VDR Proteinen. Der T nach C Basenaustausch führt durch Veränderung des Translationsstartpunkts zu einem um drei Aminosäuren verkürzten Protein. Das, durch das so genannte f-Allel kodierte, längere Protein, besitzt schwächere Aktivität als Transkriptionsfaktor für VDR spezifische Zielgene. Die kürzere Variante, durch das F bzw. C-Allel kodiert, besitzt im Vergleich zum längeren Protein stärkere Aktivität.
SYMBOL POLYMORPHISMUS AR(CAG)n short > long alleles Im Exon 1 des Androgenrezeptor-Gens (AR) befindet sich ein prominenter polymorpher CAG-Trinucleotide-Repeat- Polymorphismus. Die polymorphe Anzahl der Wiederholungen der CAG Sequenz im AR Gen beeinflusst die Effizienz des Rezeptors: die Anzahl ist invers mit der Fähigkeit, die Androgenwirkung über den Rezeptor zu vermitteln, assoziiert - Allele mit weniger CAG-Repeats sind aktiver.
SYMBOLrs NCBIPOLYMORPHISMUS ESR1rs IVS T/C (p/P) Einer der am häufigsten untersuchten Polymorphismen im ESR1 Gen ist der sogenannte PvuII Polymorphismus. Obwohl diese Genvariante im nicht kodierenden Teil des Rezeptorgens liegt, scheint sie auf die Stärke der Transkription des Gens einen Einfluss zu nehmen. Auf Grund klinischer Untersuchungen konnte gezeigt werden, dass der p/p Genotyp die Östrogenwirkung am schwächsten vermittelt. Deshalb geht man davon aus, dass dieser Polymorphismus entweder in die Transkriptionsgeschwindigkeit eingreift oder mit einer anderen funktionellen Genvariante assoziiert ist.
SYMBOLrs NCBI POLYMORPHISMUS CYP17A1rs T/C Pos. -34 Dieser Polymorphismus wird auch als MspA1 A1/A2 bezeichnet. Der CYP17A1 -34 T/C Polymorphismus befindet sich in der Promoterregion des Gens. Obwohl die Funktion dieses Basenaustausches noch nicht vollständig geklärt ist, konnte gezeigt werden, dass das C Allel mit einer erhöhten Transkription des Gens und bei Frauen mit erhöhten Serum Estradiol Spiegeln assoziiert ist.
SYMBOL rs NCBI POLYMORPHISMUS CYP19A1rs C/T Pos Einer der wohl am häufigsten untersuchten Polymorphismen im CYP19A1-Gen ist die C/T Pos Variante in der so genannten „3‘ nicht translatierten Region“ des Gens. Eine funktionelle Rolle konnte diesem Polymorphismus bisher nicht zugeordnet werden, vielmehr geht man davon aus, dass C/T Pos mit einem funktionellen Polymorphismus, der bis dato noch nicht identifiziert werden konnte, genetisch verbunden ist („linkage“). Ungeachtet dessen geht dieser Basenaustausch bei postmenopausalen Frauen mit erhöhten Estrone und Estradiolspiegeln und einem erhöhten Verhältnis Estron : Androstenedion und Estradiol : Testosteron einher.
SYMBOL s NCBIPOLYMORPHISMUS CYP1A1 rs T>C (MspI)3801T>C CYP1A1rs Ile462ValIle462V Der MspI und der Ile(462)Val SNP sind mit erhöhter Aktivität und Induzierbarkeit verbunden.
SYMBOL rs NCBI POLYMORPHISMUS CYP1B1rs Leu432Val CYP1B1rs Asn453Ser Vor allem zwei Polymorphismen im CYP1B1 Gen wurden häufig untersucht. Der CYP1B1*3 (Leu/Val Codon 432), der mit gesteigerter Aktivität des CYP1B1 Enzyms und der CYP1B1*4 (Asn/Ser Codon 453), der mit verminderter Aktivität einhergehen kann.
SYMBOL s NCBIPOLYMORPHISMUS SRD5A2rs Ala49Thr SRD5A2rs Val89Leu Vor allem zwei Polymorphismen, gehen mit einer Änderung der Steroid 5-alpha-reductase type 2 (SRD5a2) Aktivität einher, nämlich der Val89Leu und der Ala49Thr. Der Val89Leu Austausch ist mit einer Reduktion der Aktivität verbunden, wohingegen der Ala49Thr Austausch in vitro mit einer 5 fach erhöhten Aktivität assoziiert ist.