Die Zelle – ein komplexes Ding
RNA-Polymerasen
PM MM FeatureProbe Pair Wilcoxon test nicht-parametrisch gepaart Testet PM > MM Gesättigter Wert Berechnung eines repräsentativen Expressionswertes und einer Signifikanz 75% Perzentil der PM-Intensitäten
Expressionsanalyse in der Krebsforschung GenexpressionProteinexpression Phänotyp Differenzielle Genexpression Differenzielle Proteinexpression Kandidatengen: differenziell exprimiert in Tumorzellen für Diagnostik und Therapie Am Beispiel des Bronchialkarzinoms
Oligo-Array-Experiment Extraktion der poly-A-RNA Fragmentierung Hybridisierung Färbung Amplifikation und Markierung der RNA
cDNA-Array Technology Microarray 1. Microarray preparation PCR-Amplification of the genes of interest (one gene - one tube) Spotting of each cDNA on a defined place 3. Hybridization 2. Sample preparation 4. Image and data analysis Cell collection mRNA extraction, amplification Flourecence Labeling Red/Green-ratio background corrected intensity