DNA-ABBAUENDE MIKROORGANISMEN Projektarbeit Nicole Fried und Reto Gianotti
INHALTSÜBERSICHT Einleitung / Begrüssung Projektablauf Theorie: Mikroorganismen und DNA-Abbau Resultate Diskussion / Ausblick Fragen
AUFGABENSTELLUNG / PROJEKTABLAUF Fragestellung: Können Mikroorganismen DNA-abbauen und als Nährstoffe nutzen? Literaturrecherche: DNA-Abbau Nachweismethoden Identifizierung der Organismen
PROJEKTABLAUF Plattengiessen (DNase Test Agar von Sigma) Agar, 15 g/L DNA, 2 g/L NaCl, 5 g/L Tryptose, 20 g/L Aussuchen und Ausstreichen der Organismen Herstellen von Reinkulturen Testen auf Dnase-Aktivität Vorschrift von Waller, J. R et al 1985
THEORIE: DNA-AUFNAHME Transformation Transduktion Konjugation Aufnahme von DNA Aus der Umgebung Injektion durch Phagen Austausch
DNA-AUFNAHME Anheften des Pilus. Anlagerung Proteine und Einzelstrangbruch Replikation und Transfer. Bildung zirkulärer DNA Überspiralisierung mittels Topoisomerasen und Trennung der Zellen
THEORIE: DNA-ABBAU Organismen haben häufig Kontakt mit fremd DNA z.B. Viren können Zellstoffwechsel stören oder zum Zelltod führen Abwehrmechanismus: Restriktionsenzyme Endonucleasen Exonucleasen
THEORIE MIKROORGANISMEN Mikroorganismus Quelle Actinomyceten Bodenproben Pseudomonas E. coli Enterobakterien Klährschlamm Bacillen Hefe Chromobakterien Bodenprobe Unbekannte Organismen Unbekannt Umgebungsluft Klärschlamm
RESULTATE DNASE-AKTIVITÄT Negativ • Actinomyceten • Bacillen • Chromobakterien •Pseudomonaden • Unbekannte Organismen 1-4
RESULTATE DNASE-AKTIVITÄT Positiv • Sedimentationsplatten DK 1,2,3 und 5 • Belebtschlamm 1.1.1, 1.2.1, 1.3.1 Links:1.1.1 Rechts.1.2.1 Oben:1.3.1
RESULTATE IDENTIFIKATION MS-Maldi-TOF • DK 2: Staphylococcus capitis • DK 3: Moraxella sg Moraxella osloensis • Keim 1.1.1: Serratia liquefaciens • Keim 1.3.1: Aeromonas caviae Die anderen Organismen konnten nicht identifiziert werden.
DISKUSSION / AUSBLICK • Bodenproben negativ • Enterobakterien negativ • Belebtschlamm positiv • Umgebungsluft positiv • Identifizierung: Gram-negative Bakterien API • Mehrere Organismen untersuchen
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