Thomas Zauner Nicole Jahr SELDI Thomas Zauner Nicole Jahr
SELDI Surface Enhanced Laser Desorption/Ionization
Allgemeine Funktionsweise Chromatographie + MALDI-TOF
Chromatographie Affinitätschromatographie/Ionenaustauschchromatographie ProteinChip-Arrays: → variable Eigenschaften
voraktivierte Oberflächen Bsp.: Aluminium-Streifen mit 8 oberflächenaktiven Spots Kupplung mit Proteinen Zugabe selektiver Waschpuffer
MALDI-TOF Zugabe einer Matrix auf den ProteinChip Separation und Detektion durch TOF-Spektrometer Laser Flugrohr ProteinChip Intensity Molecular Mass (Da)
SELDI - Technologie
Einsatzbereiche für SELDI für Proteine und Peptide geeignet Massenbereich: zwischen 1 – 20 kDa
Vorteile komplexe biologische Proben einsetzbar hohe Toleranz gegenüber Detergenzien und Salzen Quantitative Erfassung hoher Probendurchsatz (Automatisierung)
Bindungsstudien → Antigen/Antikörper → Rezeptor-Ligand enzymatische Reaktionen → verlustfrei on Chip → dokumentarischer Zeitverlauf möglich sehr leichte Entwicklung von Reinigungs-Protokolle
Nachteile weniger vorteilhaft > 20 kDa Limitierung der Detektion von gebundenen Proteinen geringere Auflösung im Vergleich zu MALDI
Ausblick Detektion von Tumormarkern Affinitätsstudien 2 weitere Vorträge zur Anwendung
Literatur [1] Volker Seibert, Gabriela Lischetti, Jörn Meuer, Thomas Buschmann, Andreas Wiesner ,Detektion von Tumormarkern mit der ProteinChip®-Technologie Nachweis gruppenspezifischer Proteinmuster spezialisiert ist; BIOspektrum · Sonderausgabe · 8. Jahrgang, S. 512- 513 [2] Judith Y.M.N. Engwegen, Marie-Christine W. Gast, Jan H.M. Schellens, Jos H. Beijnen; Clinical proteomics: searching for better tumour markers with SELDI-TOF mass spectrometry; TRENDS in Pharmacological Sciences Vol.27 No.5 May 2006;S 251- 259 [3] Volker Seiberta, Andreas Wiesnerb, Thomas Buschmanna, J.orn Meuer; Surface-enhanced laser desorption ionization time-of-.ight mass spectrometry (SELDI TOF-MS)and ProteinChips technology in proteomics research; Pathology – Research and Practice 200 (2004) 83–94 [4] Ning Tang, Pete Tornatore, and Scot R. Weinberger; CURRENT DEVELOPMENTS IN SELDI AFFINITY TECHNOLOGY; Mass Spectrometry Reviews, 2004, 23, 34–44 [5] http://www.arbeitskreis-ms.biochem.uni-erlangen.de/Humeny/Seldi.htm [6] http://www.med.uni-jena.de/chip/Deutsch/SELDI.htm [7] http://www.ciphergen.com/showpub.aspx?id=303 [8] www.ipht-jena.de