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Praktikum Graphen und biologische Netzwerke Xu, Jie Hu, Shichao Jin, Yan.

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Präsentation zum Thema: "Praktikum Graphen und biologische Netzwerke Xu, Jie Hu, Shichao Jin, Yan."—  Präsentation transkript:

1 Praktikum Graphen und biologische Netzwerke Xu, Jie Hu, Shichao Jin, Yan

2 Schritt.1 ● Matching Genenamen zwischen 2 Tabellen ● Tabelle Develop: Die Daten von 3 Spezies: – Zeile: Genenamen – Spalte: 36 Instanzen der Individuellen ● Tabelle TF: ● 280 Genenamen ● Ausgabe: Tabelle Matching(270*36) ● 270 Matching

3 ● Cor.test Funktion zwischen Tabelle Develop und Tabelle Matching ● Cor.test Ergebnis: Cor Value und P Value ● Bedingung: P<0.05, Cor!=1 ● Ausgabe: Tabelle.CorValue(270*12099) Schritt.2

4 Schritt.3 ● Eingabe: Tabelle.CorValue ● Zwischenergebnisse: GenevsTF, TFvsTF, TFvsGene ● Ausgabe: Tabelle.Omega(270*270) ● - durch Algorithmus wird die Werte “Omega” gerechnet ● One-leave-method ● -36 neue Tabelle

5 Schritt.4 ● Vereinigung die Tabelle.Omega ● Distanz-Value ● Dis[x,y]=sum((A[x,y]-B[x,y])^2) ● Tabelle.DistanzValue (39*39) ● Plot() ● -Graph der DistanzValue wird erzeugt

6 Distanzen


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