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Veröffentlicht von:Eduard Stiller Geändert vor über 11 Jahren
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Untersuchungen zur Funktion des P38IP-Gens bei Prostatakarzinomzelllinien Ergebnisse PC-3 Doreen Kunze 29.03.05
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Gliederung 1.Zeitabhängigkeit (Ernte 12-72 h nach TF-Start) 2.Konzentrationsabhängigkeit (50-1000 nM) 3.Bestimmung der Apoptoserate 4.Zellzyklusmessung 5.WST-Test (siRNA-D3 und D5) 6.Zellkoloniebildungstest
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1. Zeitabhängigkeit Zelllinie: PC-3 Transfektionsbedingungen: Konzentration siRNA: 250 nM siRNA : DOTAP = 1 : 4 TF-Zeit: 4 h Ernte nach 12, 24, 48 und 72 h RNA-Isolierung, cDNA-Synthese quantitative RT-PCR
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1. Zeitabhängigkeit siRNA-Konstrukte: Sekundärstrukturvorhersage: D1 (2245-2263 bp)10x10 D2 (2215-2233 bp)13x10 D3 (1024-1042 bp) 1x10 1x9 D4 (440-458 bp) 9x10 1x9 D5 (1288-1306 bp) 2x10 3x9 axb: a – Anzahl der Nukleotide im Konstrukt die b erfüllen b – WSK, dass Nukleotid in 10 vorhergesagten Sekundärstrukturen einzelsträngig ist ( 10 = 100 % )
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1. Zeitabhängigkeit Ergebnisse: Inhibierung der P38IP-mRNA-Expression (relativ zu PBGD), normiert auf ns-siRNA h nach TF- Start siRNA-D1siRNA-D2siRNA-D3siRNA-D4siRNA-D5 1242 %49 %22 %55 %12 % 2450 %58 %40 %56 %16 % 4845 % 32 %67 %23 % 7256 %50 %36 %93 %31 %
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2. Konzentrationsabhängigkeit Ergebnisse: Inhibierung der P38IP-mRNA-Expression (relativ zu PBGD), normiert auf ns-siRNA Konstrukt50 nM125 nM250 nM375 nM500 nM750 nM siRNA-D377 %66 %79 %55 %36 %63 % siRNA-D589 %51 %50 %43 %26 %51 %
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3. Bestimmung der Apoptoserate TF mit siRNA-D5 (125 nM) keine signifikanten Unterschiede !!! Apoptosemessung 24, 48 und 72 h nach TF-Start siRNA-D5 48 hns-siRNA 48 hunbehandelt 48 h
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4. Zellzyklusmessung TF mit siRNA-D5 (125 nM) Abnahme S-Phase wegen 100% dicht !! Zellzyklusmessung 24, 48 und 72 h nach TF-Start
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5. WST-Test siRNA-D3 und D5 - Transfektion der PC-3-PCa-Zellen mit siRNA-D3 und D5 (125 und 250 nM)
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6. Zellkoloniebildungstest - Transfektion der PC-3-PCa-Zellen mit siRNA-D3 und D5 (125 und 250 nM)
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