Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und Anwendungspragmatik GMDS-Jahrestagung 2005, Freiburg Mittwoch, 14. September 2005 Dr. Josef Ingenerf Institut für Medizinische Informatik Universität zu Lübeck

Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck

Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Ingenerf, Lübeck

Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Ingenerf, Lübeck

Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? ISO/TC 215/WG 3 "Semantic content" (vorher "Health concept representation“) Ingenerf, Lübeck

Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck

Typisierung von Terminologien Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC Hierarchisierung Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck

LOINC-Terminologie (RELMA) Ingenerf, Lübeck

Alpha-ID (“Entry Terms” der ICD-10) Ingenerf, Lübeck

Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint? Typisierung von Terminologien i.w.S. Ordnungssystem für Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck

Unterscheidung von Begriff, Thema, Klasse Thema (Deskriptor, Schlagwort, Topic) Wüster, E (1971). Begriffs- und Themaklassifikation: Unterschiede in ihrem Wesen und in ihrer Anwendung. Nachrichten für Dokumentation 22 (3 & 4): 98-104 & 143-150. Ingenerf, Lübeck

MeSH-Thesaurus Ingenerf, Lübeck

logische Begriffshierarchie MeSH-Thesaurus Themenhierarchie versus logische Begriffshierarchie Soualmia, LF, Golbreich, C, Darmoni, SJ (2004). Representing the MeSH in OWL: Towards a Semi-Automatic Migration. In: Hahn, U (ed.). Proc. of the First Int. Workshop on Formal Biomedical Knowledge Representation (KR-MED 2004) in Whistler (BC), Canada, 1 June, 2004. Online-Publikation (CEUR-Workshop Proceedings), siehe http://CEUR-WS.org/Vol-102/, 81-87. Ingenerf, Lübeck

MeSH-Thesaurus Nelson, SJ, Johnston, D, Humphreys, BL (2001). Relationships in Medical Subject Headings (MeSH), chapter 11. In: Bean, CA, Green, R (eds.). Relationships in the Organization of Knowledge. New York: Kluwer Academic Publishers, 171-184. Ingenerf, Lübeck

MeSH-Thesaurus: Deskriptor- und Konzeptebene desc2005.dtd Ingenerf, Lübeck

Typisierung von Terminologien Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC - Einfache Themenliste Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Hierarchisierung Thesaurus oder multi- axiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck

ICD-Klassifikation: Systematik Statistische Klassifikation versus Formales Begriffssystem Ingenerf, J, Giere, W (1998). Concept oriented Standardization and Statistics oriented Classification: Continuing the Classification versus Nomenclature Controversy. Meth.Inform.Med. 37 (4-5): 527-539. Ingenerf, Lübeck

Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10 … ICD-10 Text der ICD K25.9 Ulcus ventriculi K25.9 Magenulkus K25.9 Magengeschwür K25.9 Magenschleimhautdefekt K25.9 Ulcus pyloricum K25.9 (B96.81!) Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculi K25.9 (F54) Psychogenes Magenulkus … … Synonymie? Ingenerf, Lübeck

Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10 … ICD-10 Text der ICD K25.9 Ulcus ventriculi K25.9 Magenulkus K25.9 Magengeschwür K25.9 Magenschleimhautdefekt K25.9 Ulcus pyloricum K25.9 (B96.81!) Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculi K25.9 (F54) Psychogenes Magenulkus … … SNOMED-CT 14532008 6296006 253740007 9660004 5565008 42666000 53189005 … Ingenerf, Lübeck

Typisierung von Terminologien i.w.S. Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Hierarchisierung Statistische Klassifikation, z.B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multi- axiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck

Begriffsorientierte Terminologie SNOMED-CT Smith, B, Ceusters, W, Temmermann, R (2005). Wüsteria. In: Geissbuhler, A, Baud, R, Lovis, C (eds.). Proc. of the MIE 2005 conference, Geneva (Switzerland), 6 pages. Formales Begriffssystem Deduktion von Begriffswissen Beachtung von ontologischen Prinzipien Ingenerf, Lübeck

Begriffsorientierte Terminologie „SNOMED-CT“ 89662003 Helicobacter-assoziiertes pylorisches Ulkus (Störung) Fully defined by ... - ist ein/e - 128070006 infektiöse Krankheiten des Abdomens - 312121001 bakterielle Infektionskrankheit des Magen-Darm-Trakts - 39204006 pylorusnahes Magengeschwür - 6185008 in Verbindung mit Helicobacter stehende Krankheit - verursachendes Agens 80774000 Helicobacter pylori - Group - assoziierte Morphologie 56208002 Geschwür - Befundlokalisation 280119005 Struktur des Magenpförtners Ingenerf, Lübeck

Typisierung von Terminologien Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Hierarchisierung Monoaxiales Begriffssystem (Taxonomie) Statistische Klassifikation, z.B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multi- axiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Einfache Postkoordination Multiaxiales Begriffssystem, z.B. SNOMED II/III Formale Postkoordination Formales Begriffssystem, z.B. SNOMED CT Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck

Zusammenfassung Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten) Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Hierarchisierung Monoaxiales Begriffssystem (Taxonomie) Statistische Klassifikation, z.B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multi- axiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Einfache Postkoordination Multiaxiales Begriffssystem, z.B. SNOMED II/III Formale Postkoordination Formales Begriffssystem, z.B. SNOMED CT Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck