GMDS-Jahrestagung 2005, Freiburg Mittwoch, 14. September 2005

Präsentation zum Thema: "GMDS-Jahrestagung 2005, Freiburg Mittwoch, 14. September 2005"—  Präsentation transkript:

1 Standardisierte Terminologien in der Medizin zwischen Begriffssemantik und Anwendungspragmatik
GMDS-Jahrestagung 2005, Freiburg Mittwoch, 14. September 2005 Dr. Josef Ingenerf Institut für Medizinische Informatik Universität zu Lübeck

2 Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?
Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck

3 Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?
Ingenerf, Lübeck

4 Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?
Ingenerf, Lübeck

5 Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?
ISO/TC 215/WG 3 "Semantic content" (vorher "Health concept representation“) Ingenerf, Lübeck

6 Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?
Typisierung von Terminologien Ordnungssystem für Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck

7 Typisierung von Terminologien
Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC Hierarchisierung Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck

8 LOINC-Terminologie (RELMA)
Ingenerf, Lübeck

9 Alpha-ID (“Entry Terms” der ICD-10)
Ingenerf, Lübeck

10 Vortragsinhalte Standardisierte Terminologie: Was ist gemeint?
Typisierung von Terminologien i.w.S. Ordnungssystem für Begriffe => Begriffsorientierte Terminologien Klassen => Statistische Klassifikationen Themen => Kontrollierte Thesauren Zusammenfassung Ingenerf, Lübeck

11 Unterscheidung von Begriff, Thema, Klasse
Thema (Deskriptor, Schlagwort, Topic) Wüster, E (1971). Begriffs- und Themaklassifikation: Unterschiede in ihrem Wesen und in ihrer Anwendung. Nachrichten für Dokumentation 22 (3 & 4): & Ingenerf, Lübeck

12 MeSH-Thesaurus Ingenerf, Lübeck

13 logische Begriffshierarchie
MeSH-Thesaurus Themenhierarchie versus logische Begriffshierarchie Soualmia, LF, Golbreich, C, Darmoni, SJ (2004). Representing the MeSH in OWL: Towards a Semi-Automatic Migration. In: Hahn, U (ed.). Proc. of the First Int. Workshop on Formal Biomedical Knowledge Representation (KR-MED 2004) in Whistler (BC), Canada, 1 June, Online-Publikation (CEUR-Workshop Proceedings), siehe Ingenerf, Lübeck

14 MeSH-Thesaurus Nelson, SJ, Johnston, D, Humphreys, BL (2001).
Relationships in Medical Subject Headings (MeSH), chapter 11. In: Bean, CA, Green, R (eds.). Relationships in the Organization of Knowledge. New York: Kluwer Academic Publishers, Ingenerf, Lübeck

15 MeSH-Thesaurus: Deskriptor- und Konzeptebene
desc2005.dtd Ingenerf, Lübeck

16 Typisierung von Terminologien
Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC - Einfache Themenliste Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Hierarchisierung Thesaurus oder multi- axiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck

17 ICD-Klassifikation: Systematik
Statistische Klassifikation versus Formales Begriffssystem Ingenerf, J, Giere, W (1998). Concept oriented Standardization and Statistics oriented Classification: Continuing the Classification versus Nomenclature Controversy. Meth.Inform.Med. 37 (4-5): Ingenerf, Lübeck

18 Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10
… ICD-10 Text der ICD K25.9 Ulcus ventriculi K25.9 Magenulkus K25.9 Magengeschwür K25.9 Magenschleimhautdefekt K25.9 Ulcus pyloricum K25.9 (B96.81!) Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculi K25.9 (F54) Psychogenes Magenulkus … … Synonymie? Ingenerf, Lübeck

19 Alpha-ID: Nummerierter alphabetischer Index der ICD-10
… ICD-10 Text der ICD K25.9 Ulcus ventriculi K25.9 Magenulkus K25.9 Magengeschwür K25.9 Magenschleimhautdefekt K25.9 Ulcus pyloricum K25.9 (B96.81!) Infektion durch Helicobacter pylori bei Ulcus ventriculi K25.9 (F54) Psychogenes Magenulkus … … SNOMED-CT … Ingenerf, Lübeck

20 Typisierung von Terminologien i.w.S.
Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Hierarchisierung Statistische Klassifikation, z.B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multi- axiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Einfache Postkoordination Formale Postkoordination Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck

21 Begriffsorientierte Terminologie SNOMED-CT
Smith, B, Ceusters, W, Temmermann, R (2005). Wüsteria. In: Geissbuhler, A, Baud, R, Lovis, C (eds.). Proc. of the MIE 2005 conference, Geneva (Switzerland), 6 pages. Formales Begriffssystem Deduktion von Begriffswissen Beachtung von ontologischen Prinzipien Ingenerf, Lübeck

22 Begriffsorientierte Terminologie „SNOMED-CT“
Helicobacter-assoziiertes pylorisches Ulkus (Störung) Fully defined by ... - ist ein/e infektiöse Krankheiten des Abdomens bakterielle Infektionskrankheit des Magen-Darm-Trakts pylorusnahes Magengeschwür in Verbindung mit Helicobacter stehende Krankheit - verursachendes Agens Helicobacter pylori - Group - assoziierte Morphologie Geschwür - Befundlokalisation Struktur des Magenpförtners Ingenerf, Lübeck

23 Typisierung von Terminologien
Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten) System von Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Hierarchisierung Monoaxiales Begriffssystem (Taxonomie) Statistische Klassifikation, z.B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multi- axiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Einfache Postkoordination Multiaxiales Begriffssystem, z.B. SNOMED II/III Formale Postkoordination Formales Begriffssystem, z.B. SNOMED CT Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck

24 Zusammenfassung Bildungs- prinzipien System von Begriffen (Worten)
Klassen/Themen Präkoordination, Identifikation Enumerative Begriffsliste, z.B. Alpha-ID, LOINC - Einfache Themenliste - Klassierter Wertebereich Einfache Themenhierarchie, z.B. Gelbe Seiten Hierarchisierung Monoaxiales Begriffssystem (Taxonomie) Statistische Klassifikation, z.B. ICD-10, NLM-Klass. Thesaurus oder multi- axiale Themenklassifikation, z.B. MeSH, Colon-Klass. Einfache Postkoordination Multiaxiales Begriffssystem, z.B. SNOMED II/III Formale Postkoordination Formales Begriffssystem, z.B. SNOMED CT Abstract-Band, S.80 Ingenerf, Lübeck