LOINC und CDISC LAB - Einführung und Übersicht

Präsentation zum Thema: "LOINC und CDISC LAB - Einführung und Übersicht"—  Präsentation transkript:

1 LOINC und CDISC LAB - Einführung und Übersicht
Herzlich Willkommen! CDISC User Group DE, Stuttgart, IBM Forum, Di LOINC und CDISC LAB - Einführung und Übersicht Sebastian Claudius Semler Wissenschaftlicher Geschäftsführer, Telematikplattform für Medizinische Forschungsnetze (TMF) e.V. Berlin gemeinsam mit Jozef Aerts, Kurt Hellstern

2 Anwendungsfälle für LOINC ? LOINC Werkzeuge
Gliederung Was ist LOINC ? S.C. Semler Anwendungsfälle für LOINC ? LOINC Werkzeuge Nutzung & Relevanz von LOINC Was ist CDISC LAB ? J. Aerts Erfahrungen mit CDISC LAB K. Hellstern LOINC in CDISC LAB, Summary S.C. Semler

3 Was ist LOINC ?

4 LOINC ® = Logical Observation Identifier Names and Codes
Was ist LOINC ? LOINC ® = Logical Observation Identifier Names and Codes Nomenklatur (Code-System) zur universellen Kennzeichnung von Laborbestimmungen, Vitalwerten und weiteren klinischen Messungen/Beobachtungen Erstellt/gepflegt vom LOINC-Komitee am Regenstrief Institute / Indianapolis (USA) unter Beteiligung von Freiwilligen aus dem akademischen Bereich Freiwilligen aus der Industrie US-Regierungsvertretern. Ursprüngliche Fokussierung auf den Laborbereich wurde auf sämtliche klinischen Mess- und Beobachtungsparameter erweitert. Funding: u.a. National Library of Medicine (NLM), Centers for Disease Control and Prevention (CDC), John A. Hartford Foundation

5 bereitgestellt als Access-Datenbank oder TXT-Datei
LOINC - Verfügbarkeit bereitgestellt als Access-Datenbank oder TXT-Datei gemeinfrei ! (Copyright-geschützt, aber zum freien Einsatz) User Manual in mehreren Sprachen (auch deutsch)  Ausführliches Handbuch mit Feldbeschreibungen Tools: Mapping-Tool RELMA ® = Regenstrief LOINC Mapping Assistant (mit eigener Datenbank) HL7-Prüf-Werkzeug HL7-LINT FAQ, Schulungsmaterial (Folien) Online Training User Forum

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7 Einträge in der LOINC-Datenbank 1994-2008

8 Entwicklung der LOINC-Datenbank 1994-2008
letzte strukturelle Änderungen: v.2.26: Einführung Spalte LONG_COMMON_NAME v.2.22: Verschiebung von Spalten aus der LOINC-DB in die RELMA-DB v.2.19: Display mixed case; Umbenennungen in der Spalte SYSTEM

9 Die LOINC-Datenbank (MS Access .MDB) v.227

10 Die LOINC-Datenbank (MS Access .MDB) v.227

11 Die LOINC-Datenbank (MS Access .MDB) v.227

12 Die LOINC-Datenbank (MS Access .MDB) v.227
„CDISC Code“: nur 830 Datensätze gefüllt (Y = yes, = CDISC Code vorhanden)

13 Die LOINC-Datenbank (MS Access .MDB) v.227
insgesamt 49 Spalten (bis v.2.22 sogar >50, dann Verlagerung in RELMA-Datenbank)

14 ... wird beschrieben durch eine 6-achsige Klassifizierung:
LOINC - Inhalt Jeder Eintrag ... ... wird beschrieben durch eine 6-achsige Klassifizierung: COMPONENT = Analyt / Parameter PROPERTY = Messgröße TIME_ASPCT = Zeitl. Szenario der Messung / Beobachtung SYSTEM = Beobachtetes System SCALE_TYPE = Skalentyp METHOD_TYPE = Methode Aus diesen 6 Achsen setzt sich generische Name eines LOINC-Eintrages zusammen. ... hat einen eindeutigen numerischen 7-stelligen Code mit Prüfziffer  die „LOINC-ID“ (LOINC_NUM) ... durch weitere 48 Spalten ergänzt (Stand: v.2.27; früher >50)

15 Weitere Felder der LOINC-Datenbank
LOINC – Weitere Felder Weitere Felder der LOINC-Datenbank Related names Class (reporting convenience)  Gruppen (z.B. CHEM, SERO, BP) Classtype  lineare Klassifizierung (u.a. 1 = Laboratory; 2 = Clinical) Related names 2 neu ab v.2.26: Long Common Name SNOMED Code IUPAC Code (CAS, EC, ATCC) CDISC Code (?) Molecular Weights, Mole-ID, Formula ... ... Außerdem: Viele weitere Felder in der relationalen RELMA-Datenbank.

16 <component> : <property> :
LOINC-Nomenklatur 6-axiale Systematik der LOINC-Nomenklatur: Beispiele: <[analyte].[subclass].[sub-subclass]> ^ <[time delay] post [amount] [substance] [route])> ^ <adjustment> Name and modifier 2.1 Component/analyte name Component/analyte subname Component/analyte sub-sub-name Information Challenge (e.g., 1H post 100 g PO challenge) 2.2 Adjustments/corrections 2.3 1502-4 GLUCOSE^1H POST 100 G GLUCOSE PO MCNC PT SER QN <component> : <property> : <timing> : <system> : <scale> : <method> fakultativ ! LOINC_NUM COMPONENT PROPERTY TIME_ASPCT SYSTEM SCALE_TYP METHOD_TYP 2951-2 SODIUM SCNC PT SER/PLAS QN 8331-1 BODY TEMPERATURE TEMP MOUTH

17 Structured Names (Six Parts)
LOINC – Name: Struktur Structured Names (Six Parts) Component (Analyte) e.g., Potassium, Blood pressure systolic Property measured e.g., Substance concentration, pressure Time aspect e.g., PT, 1H, 24 H System (Specimen,Organ) e.g., SER/PLAS, BLD, UR, STL,^PATIENT Precision / Scale Type e.g., QN, ORD, NOM Method e.g., RAI, MRI, Angiogram Structure of Component/Analyte Formal name e.g., Glucose Challenge e.g, 1H post 100 gm Glucose PO Relation e.g, Fetus, Control, Blood Product Unit, adjusted to pH 7.4 (Quelle: C.McDonald / Regenstrief Institute, 2001)

18 Eindeutige LOINC-ID Ist eine der 6 Achsen unterschiedlich, so gibt es einen anderen LOINC-Code ! (Quelle: HL7 User Group Deutschland, 2000)

19 PROPERTIES & UNITS – Einige Beispiele:
LOINC – Name: PROPERTY PROPERTIES & UNITS – Einige Beispiele:

20 LOINC – Anwendungsbereiche
Clinical LOINC Vital Signs Fluid Intake/Output Body Measurements Hemodynamic measures Emergency Department Respiratory Therapy EKG (ECG) Cardiac/Obstetr. Ultrasound Pathology Findings Colonoscopy/Endoscopy Radiology reports History & Physical Discharge Summary Clinical Documents Tumor Registry Laboratory LOINC Blood bank Chemistry Coagulation Cytology Fertility Toxicology Hematology Microbiology Molecular pathology Surgical pathology (Quelle: C.McDonald / Regenstrief Institute, 2001)

21 Beispiele: Blutbild & Elektrolyte

22 Anwendungsfälle für LOINC ?
LOINC in der Patientenversorgung LOINC in der medizinischen Forschung LOINC in HomeCare, TeleMonitoring etc.

23 Standardisierte Datenkommunikation
Einsatz Standardisierte Datenkommunikation LOINC ist in den gängigen Datenaustauschformaten nutzbar: HL7 – OBX-Segment  Feld OBX-3 (Observation Identifier) auch HL7 v.2 XML LDT – Standard  Feld 8410 (n) Test-Ident (M) CDISC LAB (+SDTM) CCR openEHR auch in standardisierten digitalen Dokumenten HL7 v.3 – CDA z.B. VHitG-Arztbrief SCIPHOX LOINC-ID

24 medical devices at the p.o.c.
Example: the use of an international nomenclature für coding of medical observations (LOINC) the general problem: fusion of medical observation data from multiple sources … different identifiers for the same medical observation ? medical devices at the p.o.c. ID C lab A EPR, research data base ID A Comm. Server ID A, B, C, D ??? ID B lab B ID D data entry (Quelle: Semler, 2002)

25 Beispiel multizentrische Studie
Zentrum 3 LOINC ID ! Zentrum 1 clinical trial DB (RDE) LOINC ID ! LOINC ID ! LOINC ID ! Zentrum 2 LOINC ID ! data entry (Quelle: Semler, 2002)

26 Beispiel Telemonitoring / Home Care
Handy LOINC ID ! telemed. Waage Telemoni-toring Leitstelle LOINC ID ! LOINC ID ! LOINC ID ! Blutdruck-Gürtel LOINC ID ! data entry (Quelle: Semler, 2002)

27 Nicht- vs. standardisierte Labordatenkommunikation
Labor 1: herkömmlich, HL7 Message ohne standardisierte Nomenklatur: OBX| 1| NM| XY24^SGGT^L999| 1| 95| U/L| Labor 2: OBX| 1| NM| 1234^gamma-GT^ZL| 1| 95| U/L| Labor 3: OBX| 1| NM| GGT^g-Glutamyltransferase^Hausliste| 1| 95| U/L| Labor 1: HL7 Message mit LOINC-standardisierter Nomenklatur: : OBX| 1| NM| ^SGGT^LN| 1| 95| U/L| OBX| 1| NM| ^gamma-GT^LN| 1| 95| U/L| OBX| 1| NM| ^g-Glutamyltransferase^LN| 1| 95| U/L| 3 verschiedene Parameter ??? Zuordnung über LOINC-IDs !!!

28 Struktur eines HL7 OBX Segments
Die wichtigsten Felder eines HL7-OBX-Segments: OBX-1 OBX-Set-ID = 1 OBX-1 Value Type = NM OBX-3 Observation ID = gamma-GT OBX-5 Value = 95 OBX-6 Units = U/l OBX-7 Normal range = 6-28 OBX-8 Abnormal flag = H OBX-14 Observation Date = OBX-15 Producer = Labor X LOINC-Code steht in OBX-3.1 ! + LOINC-ID: 2324-2

29 LOINC in HL7: OBX-Segmente am Beispiel -GT und GOT
Untersuchungs-ID Messwert Normwertbereich Einheit OBX|1|NM|2324-2^gamma-GT^LN||95|U/L|6-28|H||N|F||| |LabX… Kennzeichnung patholog. Wert Datum OBX|2|NM|1920-8^SGOT^LN||15|U/L|5-20|N||N|F||| |LabX… LOINC Code gibt LOINC als Kodiersystem an

30 Ebenen der Standardisierung

31 LOINC und andere Standards
LOINC und HL7 von HL7 international empfohlen zum Kennzeichnen der Laboruntersuchungsarten (v.2 + v.3 / RIM) Zusammenarbeit von LOINC Committee und HL7 Gruppe LOINC und CDA / SCIPHOX dito ( HL7) Einsatz von LOINC-Codes zur Kennung der Document Sections (siehe VHitG-HL7-Arztbrief). LOINC und DICOM LOINC auch im DICOM-Protokoll nutzbar. Aber auch Überlappungen (CLASS = RAD Codes in LOINC). LOINC und UMLS Mapping existiert an der NLM (Umfang? Einsatz?) LOINC und SNOMED CT Grundsätzlich ist jeder LOINC-Code durch einen SNOMED-Term abbildbar. Mapping nicht vorhanden.

32 LOINC und andere Standards
LOINC und IHE Lab. LOINC empfohlen in der Labordatenkommunikation IHE Technical Framework liefert Beispieltabelle mit empfohlenen gängigen LOINC-Codes LOINC und openEHR LOINC wird in der Modellierung von Archetypen intensiv genutzt (siehe jüngste Diskussionen in der openEHR-News-Group) LOINC und CDISC LOINC nutzbar im CDISC-Standard LAB und von CDISC hierfür empfohlen LOINC grundsätzlich nutzbar im CDISC-Standard ODM LOINC nur begrenzt nutzbar im CDISC-Standard SDTM Einsatz bislang nur experimentell, kein Echtbetrieb (zumindest in D und UK)

33 LOINC und andere Standards
LOINC uns xDT (nur D) LOINC wird in LDT angewendet „Problemzonen“: Overlap LOINC & VITAL Overlap LOINC & C-NPU Vermeintlicher Overlap zu SNOMED (CT) ist eher ein „strategisches Missverständnis“.

34 Austausch von Information = funktionelle Interoperation
Nutzen durch LOINC allgemeiner Nutzen: Austausch von Information = funktionelle Interoperation Gebrauch von Information = semantische Interoperation Zusammenführung von Labordaten und anderen Messdaten Qualitätssicherung Übertragbarkeit und Auswertbarkeit in anderem Kontext (Mapping auf Abrechnungspositionen) Generell: Weiterverarbeitbarkeit von klinischen Daten !

35 Probleme bei der Nutzung von LOINC
hoher Mapping-Aufwand von lokalen Untersuchungen und ihren Kürzeln auf die richtigen LOINC-Codes Filter in der LOINC-Datenbank nutzen RELMA benutzen fehlende Codes zu hohe Granularität fehlende Hierarchien, keine „sprechenden Codes“ komplexe Logik mit Einheiten- und Referenzwertverwaltung erforderlich Overlap zu anderen Standards C-NPU VITAL SNOMED keine deutsche Übersetzung, keine fachliche Guidance

36 Wichtig: Was ist LOINC nicht ?
LOINC ist keine Taxonomie, keine Klassifikation i.e.S. – sondern eine hochgranulare Code-Liste (ein „dummes“ Vokabular mit kaum Beziehungen der Codes untereinander). LOINC ist kein Datenaustauschformat und kein Datenkommunikationsprotokoll – sondern kann in solchen Datenaustauschformaten und Protokollen benutzt werden (HL7, xDT, CDA u.a.). LOINC ist kein komplettes Informationsmodell für Laborbestimmungen (das wären z.B. openEHR-Archetypen). LOINC ist kein Standard für die Einheitenverwaltung von Messgrößen (das ist UCUM) – LOINC unterscheidet lediglich unterschiedliche Messgrößen (PROPERTY) je Analyt / Beobachtung / Komponente. LOINC ist kein Standard für die Verwaltung und Angabe von Referenzwertebereichen (Normalwerten).

37 die LOINC Datenbank selbst
LOINC Werkzeuge die LOINC Datenbank selbst RELMA (Mapping- & Recherche-Werkzeug, mit RELMA-Datenbank und mehreren Oberflächen) HL7-Lint LOINC Handbuch (englisch + deutsch) Resourcen auf der Webseite von (Regenstrief Institute / Indiana)

38 LOINC Webseite

39 RELMA = Regenstrief LOINC Mapping Assistant Start

40 RELMA = Regenstrief LOINC Mapping Assistant „Panels“

41 RELMA = Regenstrief LOINC Mapping Assistant Verwalten & Zusammenstellen von „Panels“

42 RELMA = Regenstrief LOINC Mapping Assistant Verwalten & Zusammenstellen von „Panels“

43 RELMA = Regenstrief LOINC Mapping Assistant Finden von LOINC-IDs in „Panels“

44 RELMA: Mapping  Local Terms

45 RELMA: Mapping  Local Terms

46 HL7-Lint: Überprüfen von LOINC-Angaben in HL7-Nachrichten

47 LOINC Handbuch User Manual (original, englisch) erläutert die Struktur und Tabelle der LOINC-Datenbank; erhältlich über deutsche Übersetzung des Handbuchs (2006), durch das DIMDI beauftragt, Versions-pflege durch das DIMDI Qualitätssicherung deutscher Übersetzungen von Codes derzeit vom DIMDI ausgeschrieben

48 Nutzung, Relevanz und Perspektive von LOINC

49 Von ANSI, ISO/CEN und DIN empfohlen und damit zum Standard erkoren
Anwendung von LOINC Von ANSI, ISO/CEN und DIN empfohlen und damit zum Standard erkoren von HL7 als präferiertes Kodiersystem zur Ergebnisübermittlung empfohlen und als solches Bestandteil des HL7-Standards in den USA schon heute verbreitet im Einsatz in nahezu jeder Standardisierungsinitiave heutzutage empfohlen – national (bit4health-Konzept für eGK-Projekt, VHitG-Arztbrief) wie international (ISO/CEN, IHE LAB)

50 LOINC international – wo stehen die anderen ?
Weite Verbreitung in den USA: „LOINC has been endorsed by the American Clinical Laboratory Association and the College of American Pathologists. It has been adopted as an alternate test reporting code by large commercial laboratories including Quest, LabCorp, Mayo Medical Laboratories, and MDS Labs; large HMOs including Kaiser Permanente and Aetna; governmental organizations including the CDC, DOD, VA, and NLM; and has also been adopted by Germany, Switzerland and two Canadian provinces. … Current draft proposals for Health Insurance Portability and Accountability Act (HIPAA) electronic claim attachment standards are based on LOINC codes.“ Quelle: LOINC Webseite

51 LOINC (Teil-)Übersetzungen
LOINC Übersetzungen + Teilübersetzungen: Spanisch (2) Chinesisch Deutsch (CUMUL /CH + Manual übersetzt durch DIMDI) Französisch (CUMUL / CH) Italienisch (CUMUL / CH) teilweise mehrere Quellen / Übersetzungen

52 LOINC Einsatz weltweit
LOINC im Einsatz: USA Kanada Australien Schweiz Deutschland China Korea Estland Brasilien Neuseeland … (sicherlich unvollständig – Niederlande? Frankreich?) … wobei „Einsatz“ sehr Unterschiedliches bedeuten kann.

53 LOINC in Deutschland – Historie Stand 2005 … Update 2008 ?
1995 (Anfänge von LOINC in den USA) 1997 (Beginn des CUMUL-Projekts des Schweizerischen Zentrums für Qualitätskontrolle CSCQ in CH) 2000 erster Übersichtsartikel zu LOINC in den HL7-Nachrichten (HL7 Deutschland) Beschäftigung mit LOINC in DIN NAMed FB G 1 & G 3 2001 HL7 Deutschland - Ad-Hoc-Working Group zur LOINC/VITAL-Harmonisierung erstes Projekt zur Umsetzung einer LOINC-basierten Schnittstelle in der elektronischen Laborkommunikation in einer Klinik der LVA Westfalen durch Optimal Systems GmbH Beginn eines Therapiemonitoring-Projekts mit umfassender LOINC-Standardisierung der Klinischen Pharmakologie am Universitätsklinikum Erlangen 2002 Beginn des LOINC-basierten Schnittstellenprojekts am Universitätsklinikum Kiel zur verteilten Kommunikation von Labormesswerten durch das Zentrallabor UKK und Optimal Systems GmbH Laborärzte-Arbeitskreis beginnt Sichtung von LOINC zu Zwecken der KBV-Abrechnung LOINC-Projekt auf der GMDS-Jahrestagung 2002 vorgestellt 2003 VHitG beginnt sich mit LOINC zu beschäftigen (AG Kommunikation & Applikation) LOINC in der Telematikexpertise der dt. Industrie erwähnt 2004 DIMDI übernimmt die Aufgabe, LOINC in Deutschland zu hosten LOINC User Group Deutschland formell in Berlin gegründet (Beirat: u.a. TMF, VHitG) LOINC im bit4health-Papier zur Telematikrahmenarchitektur ausführlich empfohlen erste Produkte präsentieren integrierte LOINC-Nomenklatur auf der ITeG 2004 2005

54 Die aktuell wichtigsten Einsatzfelder in Deutschland
Labormedizin Routinebetrieb: Universitätsklinikum Kiel BfA Reha-Kliniken Westfalen …? (einige Laborarztgruppen) bei einigen Labor-EDV-Systemen bereits implementiert Anästhesiologie / Intensivmedizin Anwendung für Forschung / Routinebetrieb: Universitätsklinikum Gießen Universitätsklinikum Jena Klinische Pharmakologie / Arzneimittel-Sicherheit Anwendung für Forschung / Pilotbetrieb: Universitätsklinikum Erlangen Universitätsklinikum Heidelberg bei einigen Terminologie-EDV-Systemen bereits implementiert pharmazeutische Arzneimittelzulassungsstudien: evaluiert bei Big Pharma & CROs (Schering u.a.), derzeit kein Routinebetrieb LOINC in der medizinischen Dokumentation (Kodierung von medizinischen Dokumenten und Dokumentationseinheiten) vorgesehen & implementiert im „VHitG-Arztbrief“; Anwendung in der Fläche steht noch aus Perspektiven: Medizintechnik ? Personal Health / Telemonitoring ?

55 Was ist CDISC LAB ?  JOZEF AERTS

56 Erfahrungen mit CDISC LAB ?
 KURT HELLSTERN

57 LOINC in CDISC LAB Summary Diskussion

58 CDISC - LAB Beispiel-Daten Codelists

59 Rekapitulation: Notwendigkeit semantischer Standardisierung
Semantische Standardisierung als essentielle Voraussetzung für: kontextunabhängige maschinelle Weiterverarbeitbarkeit medizinischer Daten also z.B.: Zusammenführen von Labordaten aus unterschiedlichen Laboren innerhalb einer Klinikkette Zusammenführen von Labordaten aus unterschiedlichen Laboren in einer multizentrischen klinischen Studie sektorübergreifende Kommunikation von Labor- und Vitaldaten in der integrierten Versorgung Datenintegration v. Home Care Devices / Body Area Networks Aggegration und Auswertung von klinischen Daten für Management, Qualitätssicherung oder Forschung Epidemiologie, Versorgungsforschung, Public Health übergreifende Grid-basierte IT-Infrastrukturen Datenkommunikation über Landes- & Sprachgrenzen hinweg

60 Relevanz für die pharmazeut. Industrie und die CROs?
Diskussion Relevanz für die pharmazeut. Industrie und die CROs? Vorerfahrungen u.a. bei Schering, Accovion Welche Hürden gibt es ? Welche Hilfestellung muss geboten werden ? Von wem ? DIMDI LOINC User Group und HL7 User Group Deutschland TMF CDISC USER GROUP ??!

61 Vielen Dank für Ihre Aufmerksamkeit!
Weitere Informationen:

62  Literaturliste auf www.loinc.de
Bitte zum Abschluss Bitte: Veröffentlichungen zu LOINC bzw. zu Themen mit Relevanz für LOINC & Labordatenstandardisierung (z.B. C-NPU) bitte per an melden  Literaturliste auf