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Replikation – formaler Ablauf
3` 5` 5` 3` 3` 5` Okazaki-Fragmente Problemstellung: Warum entstehen Okazaki – Fragmente?
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Replikation – Neubetrachtung auf Nukleotidebene
3` 5` 5` 1 3` 3` 5` 2 Zum Verständnis des Mechanismus wird die Replikation im Weiteren auf der Nukleotidebene verfolgt.
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Replikation – Entspiralisierung und Öffnung durch Helikase
5` 3` 5` 3`
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Replikation Ablauf am 3`Ende 3` 5` 1 5` 3` 5` Syntheserichtung
DNA-Polymerase verknüpft die Nukleotide immer vom 3` Ende zum 5`-Ende der Phosphorgruppe. Wirkungsspezifität der Polymerase! Vom 3`-Ende des Originalstrangs wird daher die DNA kontinuierlich aufgebaut.
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Replikation Ablauf am 5`Ende 3` 5` 2 3` 3` 5` Syntheserichtung
Da die Syntheserichtung dieselbe ist lässt sich kein Begründung für das Entstehen von Fragmenten finden. Dies bedeutet, dass ein weiterer Faktor entscheidend sein muss für deren Entstehung.
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Replikation mit Primer am 3` - Ende
5` 1 Replikation mit Primer am 3` - Ende 5` 3` 5` 3` 5` Primer Syntheserichtung Anlagerung eines Primers ermöglicht die Aktivität der DNA-Polymerase. Diese benötigt zum Start eine Basenpaarung (Substratspezifisch). Synthese läuft kontinuierlich durch, da immer eine Basenpaarung vorhanden ist. Der Primer selbst besteht aus RNA.
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Replikation mit Primer am 5` - Ende
3` 5` 2 Replikation mit Primer am 5` - Ende Syntheserichtung Primer Primer 5` 3` 5` 3` 3` 3` 5` Primer lagert sich an und schafft eine Basenpaarung. Dort setzt die Polymerase an und bildet ein kleines Stückchen. Vorgang wiederholt sich, da wieder Basenpaare vorhanden.
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Replikation mit Primer - Vergleich
3` 5` Kontinuierlicher Strang Primer Primer Primer Primer Primer 5` 3` Diskontinuierlicher Strang Man sieht sofort, dass für den diskontinuierlichen Strang viele RNA-Primer benötigt werden. Zum Abschluss der Replikation werden die RNA-Primer entfernt
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Replikation mit Primer - Vergleich
3` 5` Kontinuierlicher Strang 5` 3` Diskontinuierlicher Strang
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Replikation mit Primer - Vergleich
3` 5` Kontinuierlicher Strang 5` 3` Diskontinuierlicher Strang Danach schließt eine Polymerase die Lücken.
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Replikation mit Primer - Vergleich
3` 5` Kontinuierlicher Strang 5` 3` Diskontinuierlicher Strang Eine Ligase verknüpft die neuen Nukleotide mit dem Strang
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Replikation mit Primer - Vergleich
3` 5` Kontinuierlicher Strang 5` 3` Diskontinuierlicher Strang
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ENDE
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