Algorithm Engineering „Suffix-Bäume und Suffix-Arrays“ Stefan Edelkamp.

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1 Algorithm Engineering „Suffix-Bäume und Suffix-Arrays“ Stefan Edelkamp

2 Übersicht  Suffix-Mehrwegsuchbaum (-Trie)  Patricia-Bäume  Suffix-Bäume  Konstruktion von Suffix-Bäumen nach McCreight  Generalisierte Suffix-Bäume  Suffix-Arrays

3 Suffix-Tries

4 Definierende Eigenschaft

5 Suffix-Bäume (aka Suffixbäume)

6 Suffixbaum für den String 11010$

7 Definitionen

8 Notation

9 Definierende Eigenschaft

10 Beweis

11 Konstruktion von Suffix-Bäumen

12 Naives Verfahren

13 Beweis

14 Visualisierung

15 Algorithmus von McCreight Algorithmus

16 Zentrale Eigenschaft

17 Invarianten des Algorithmus

18 Bezeichnungen

19 Schritt 1: Einfügen des Ortes von head i+1

20 Schritt 2: Einfügen des Suffix- Zeigers für den Ort von head i+1

21 Korrektheit

22 Zu zeigen:

23 Beispiel

24 Analyse: Algorithmus von McCreight to be continued …

25 Analyse Rescannen

26 Analyse Scannen

27 Beispiel

28 Beispiel (ctd.)

29 Pseudo Code

30 Verwendung von Suffix-Bäumen

31 Generalisierte Suffix-Bäume

32 Beispiel

33 Beobachtungen

34 Beispiel

35 Löschen von Strings

36 Erkenntnisse

37 Korrektheit

38 Invarianz

39 Pseudo-Code

40

41 Suffix-Arrays

42 Eigenschaft

43 Beispiel

44 Engineering