Teil 1: Grundlagen und Substratbestimmungen

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1 Teil 1: Grundlagen und Substratbestimmungen
ENZYME Teil 1: Grundlagen und Substratbestimmungen

2 Glucose-6-Phosphat + H2O Glucose + Pi
Metastabiler Zustand Beispiel: Glucose-6-Phosphat + H2O Glucose + Pi [Glc6P] [H20] [Glc] [Pi] K = = x  Gleichgewicht stark auf Seite von Glc + Pi DGo‘ = kcal mol-1 (Exergonische Reaktion)  Reaktion läuft freiwillig ab! ABER: Beim Lösen von Glc6P in Wasser passiert aber scheinbar nichts!

3 Vorrausetzungen für den Ablauf einer Reaktion
Zusammenstoß der Moleküle: Räumlich richtig ! Energiereich genug ! 25 °C notwendige Energie Energiezufuhr (Temperaturer-höhung) steigert die Reaktions-geschwindigkeit ! 75 °C Aktivierungsenergie die Energie, die man einem System zuführen muß, damit die Reaktion messbar schnell abläuft

4 Energieprofil (unkatalysierte Reaktion)
DGH Aktivierungsenergie DGR A+ B DG C+ D

5 Energieprofil (enzymkatalysierte Reaktion)
EAB = Enzym-Substrat Komplex ECD = Enzym-Produkt Komplex DGH DGR E A B E+A+B DG E C D E+C+D A+B+E  EAB  ECD  C+D+E

6 Enzymkatalysierte Reaktionen
benötigen geringere Aktivierungsenergie, weil: Nährungseffekt räumlich richtige Ausrichtung der Substrate durch Bindung an Enzym Milleueffekt optimale Bedingungen für Reaktion am Enzym (pH, Solvatisierung, etc) Konformationsstreckungseffekt durch Substratbindung Gestaltänerung des Enzyms (Übergangszustand)

7 Enzymkatalysierte Reaktionen
Gleichgewicht Ein Enzym verändert die Geschwindigkeit einer Reaktion in Richtung des Gleichgewichts. Das Gleichgewicht selbst kann aber nicht verändert werden! Wenn das Gleichgewicht einer Reaktion stark auf einer Seite liegt spricht man von einer nicht umkehrbaren Reaktion. Hin- und Rückreaktion Ein Enzym kann eine Reaktion in beide Richtungen beschleunigen. Die Reaktion läuft aber immer in Richtung Gleichgewicht ab.

8 Was sind Enzyme Enzyme sind Biokatalysatoren, die die Aktivierungs-energie einer Reaktion herabsetzen können! Unterschiede zu anderen Katalysatoren sind: Spezifität für die Substrate (Gruppen) und Reaktionen Kapazität sehr hohe Effizienz (Beschleunigung bis zu 1014-fach) Regulation Aktivität kann an Umweltbedingungen angepasst werden.

9 Regulation von Enzymen
Proteinsynthese und Proteinabbau Neusynthese des gewünschten Enzyms; Aktivierung oder Deaktivierung von Genen Konformationsänderung (a) Allosterische Effekte Effektoren (Inhibitoren oder Aktivatoren) binden an regulatorisches Zentrum des Proteins

10 Allosterische Effekte
Inhibitor Aktivator Enzym inaktiv Enzym aktiv

11 Regulation von Enzymen
Proteinsynthese und Proteinabbau Neusynthese des gewünschten Enzyms; Aktivierung oder Deaktivierung von Genen Konformationsänderung (a) Allosterische Effekte Effektoren (Inhibitoren oder Aktivatoren) binden an regulatorisches Zentrum des Proteins (b) Kompetitive Hemmung „Konkurenz“ um das aktive Zentrum Chemische Veränderung Phosphorylierungen (Protein-Kinasen) oder Dephosphorylierungen (Phosphatasen)

12 Einteilung von Enzymen
1. Oxidoreduktasen Transfer von H, O oder e- von einem Substrat auf ein anderes 2. Transferasen Transfer von chem. Gruppen zwischen Substraten 3. Hydrolasen hydrolytischer Abbau 4. Lyasen nicht-hydrolytische Spaltung von Bindungen 5. Isomerasen Intramolekulare Umlagerungen 6. Ligasen Knüpfung von kovalenten Bindungen unter ATP-Verbrauch

13 Fructose + NADP+  5-Anhydro-D-Fruktose + NADH + H+
Benennung von Enzymen Beispiel: Fructose + NADP+  5-Anhydro-D-Fruktose + NADH + H+ Bezeichnung Fructose 5-Dehydrogenase Fructose:NADP 5-Oxidoreduktase Einteilung EC-Nummer, hier EC (Oxidoreduktase, wirkt an CH-OH Donoren, NAD oder NADP als Akzeptor, Enzymnummer)

14 Analytisches Arbeiten mit Enzymen
1. Enzymbestimmung Bestimmung der Biologische Aktivität  Bestimmung der Enzymaktivität Daneben kann auch der Proteingehalt bestimmt werden (z.B. mit Immunologischen Methoden) 2. Substratbestimmung Bestimmung eines Analyten (eines Substrates) mit Hilfe eines Enzyms Das Enzym muß dazu aber käuflich erhältlich sein, oder selbst gereinigt werden.

15 Enzymreaktionen

16 Enzymreaktionen

17 Enzymatische Substratbestimmung
1. Spezifisches Enzym Enzym sollte nur das Substrat umsetzen 2. Co-Substrate wo notwendig muß man Co-Substrate (Co-Enzyme) einsetzen 3. Reaktionsmilleu pH-Wert, Pufferung, Aktivatoren, etc 4. Detektionsmöglichkeit (a) Direkte Messung mittels Extinktion Produkt absorbiert, Substrat nicht (oder umgekehrt); Co-Substrat oder Co-Produkt absorbiert (b) Produktnachweis chemisch 5. Abfangreaktionen sind notwendig wenn das Gleichgewicht ungünstig liegt. Aufbau eines Testsystems

18 Das NAD(P)H-System Die reduzierte Form des Co-Substrats NADH oder NADPH absorbiert Licht im UV-Bereich bei 340 nm. Die oxidierte Form NAD+ oder NADP+ aber nicht. Universell mit Oxido- reduktasen anwendbar!

19 Bespiel: Sorbitbestimmung
SDH D-Sorbit + NAD+ D-Fruktose + NADH + H+ DE (NADH) SDH Probe + NAD+

20 Allgemeine Überlegungen 1
A + B C + D Vorraussetzungen Gleichgewicht der Reaktion liegt auf Seite von C +D [Cosubstrat] > [Probe] sonst kann nicht alles an Probe verbraucht werden

21 Allgemeine Überlegungen 2
A + B C + D Regeln v nimmt ab, wenn [c] kleiner wird. Wenn A+B mit C+D im Gleichgewicht, dann v = 0 (kein Netto-Umsatz) Konzentration (Aktivität) des Enzyms ändert v, hat aber keinen Einfluß auf den Endpunkt (DE bleibt gleich) Steigung = Geschwindigkeit

22 Bestimmung von Glu & Frc
HK 1. Glukose + ATP Glukose-6-P + ADP Reaktion nicht umkehrbar (vollständig) Auch Fruktose wird umgesetzt 2. Glu-6-P + NADP Glukonat-6P + NADPH + H+ Indikatorreaktion 3. Fructose-6-P Glucose-6-P Zusatzreaktion G6PDH PGI E t HK GDH PGI Frc Glu

23 Fehlersuche Ared + NAD+ + E Aox + NADH + H+ + E E [NAD+] hoch
t E [NAD+] hoch [Enzym] hoch Probe A Reaktion nicht umkehrbar

24 Fehlersuche Ared + NAD+ + E Aox + NADH + H+ + E E
[NAD+] nicht aus- reichend [Enzym] hoch Probe A Reaktion nicht umkehrbar t

25 Fehlersuche Ared + NAD+ + E Aox + NADH + H+ + E E [NAD+] hoch
[Enzym] gering Probe A Reaktion nicht umkehrbar t

26 Fehlersuche Ared + NAD+ + E Aox + NADH + H+ + E E [NAD+] hoch
[Enzym] hoch Keine Probe A Reaktion nicht umkehrbar t

27 Fehlersuche Ared + NAD+ + E Aox + NADH + H+ + E E [NAD+] hoch
[Enzym] hoch Keine Probe A Reaktion nicht umkehrbar t