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Input 1: Gelspots (MALDI/TRAP) I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: Übersicht Input 2: Gelfrei (MALDI/TRAP) mgf.-file Aktualisieren der DB Spektren/ Spotdatenbank+

Veröffentlicht von:Sieglinde Radder Geändert vor über 11 Jahren

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1 Input 1: Gelspots (MALDI/TRAP) I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: Übersicht Input 2: Gelfrei (MALDI/TRAP) mgf.-file Aktualisieren der DB Spektren/ Spotdatenbank+ BLAST Aktualisieren der DB Spektrendatenbank+ BLAST X Clustern/ PCA Open: Quantifizierung Einbettung Datastorage Suche mit X gegen: NCBIall/Swissprot Metagenom Spektrendatenbank Suche mit X gegen: NCBIall/Swissprot Metagenom Spektrendatenbank Spotdatenbank Biogasdatenbank

2 I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: SUCHEN X DB: Spotdatenbank DB: Spektrendatenbank DB: NCBI/ Swissprot DB: Metagenome+ BLAST+ manuel SUCHE: Ähnlichkeitssuche mit Spektren SUCHE: Standardsuche/Cloudcomputing mit Sequence, OMSA, MASCOT oder Pepnovo/BLAST (Auswahl) SUCHE: Erhöhung des Scores für gelfreie Experimente BLAST+ Auswahl

3 I. Bioinformatik Platform MPI/OVGU: Einbettung CLOUD-Computing+JAVA/SQL complet selber OpenLIMS Open MS ProteinScape

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