Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Zentrum für Biosystemanalyse (ZBSA) ( Center for Systems Biology) Albert-Ludwigs-Universität Freiburg.

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1 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Zentrum für Biosystemanalyse (ZBSA) ( Center for Systems Biology) Albert-Ludwigs-Universität Freiburg Eine im Rahmen der Ausschreibung “Lebenswissenschaftliche Zentren Baden-Württemberg” geförderte zentrale Einrichtung der Universität

2 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Systembiologie Standardisierte Systeme Quantitative, zeitauflösende Datenerhebung Modellbildung

3 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Systembiologie - Schwerpunkte ZBSA Freiburg Standardisierte Systeme Quantitative, zeitauflösende Datenerhebung Modellbildung

4 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Interaktionen im Freiburger Zentrenverbund ZBSA Zentrumfür Biosystem- analyse ZfBI Zentrumfür Bioinformatik FDM ZBSA ZfBI Biosystemanalyse Datenanalyse und Modellbildung Bioinformatik

5 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Center for Systems Biology - ZBSA Realisiert im Rahmen der Baden-Württemberischen Initiative “Lebenswissenschaftliche Zentren Das ZBSA ist interdisziplinär ausgerichtet. Räumliche Zusammenführung von Kernkompetenzen bei der Erhebung und dem Management komplexer biologischer Datensätze. Genomics (Expressionsprofilierung u.a.) Proteomics Biological Imaging Mögliche Anbindung der Mikrosystemtechnik könnte neuartige Ansätze der Datenerhebung realisieren. Räumliche Integration der mit bioinformatischen Ansätzen arbeitenden Arbeitsgruppen

6 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Wissenschaftliche Organisation des Zentrums für Biosystemanalyse Projektbereiche und Kernkompetenzen im ZBSA- Gebäude (orange) und in affiliierten Arbeitsgruppen (gelb) etablieren die Biosystemanalyse in Freiburg.

7 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Projektbereich A: Zelluläre Schaltsysteme Im Mittelpunkt steht die Zelle als unabhängige, funktionelle, biologische Einheit. Das Hauptaugenmerk liegt dabei auf der Analyse integraler Schaltsysteme der Zelle. Für definierte Schaltprozesse in der Zelle sollen relevante Systemeigenschaften erschlossen werden, die nicht nur für das jeweils betrachtete, spezielle zelluläre System von Bedeutung sind, sondern Modellcharakter für die Zelle als biologische Funktionseinheit besitzen. Beispiel: Leberzelle

8 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Projektbereich B: Regulatorische Netzwerke - Suprazelluläre Organisation Ziel der Projekte dieses Bereiches ist es, die Gesamtheit der regulatorischen Einflüsse zu verstehen, die zur Differenzierung eines bestimmten Zelltypes, der Organisation von Zellen in Organe, und letztendlich zu komplexen Funktionen wie neuronalen Verschaltungen beitragen. Beispiel: Aktivitätsmuster im Gehirn Projektbereich C: Metabolomics Ziel ist die Erstellung von Modellen zu Metabolitflüssen durch Profiling niedermolekularer und sekundärer Stoffwechselendprodukte eingerichtet werden. (= Metabolomics, d. h. nach Möglichkeit die Erfassung aller Sekundärmetaboliten). Beispiel: Metabolitflüße Vitamin-Synthesen im Reis

9 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Beiträge zum ZBSA: Life Sciences in Freiburg MPI Biologie I, II, III Forstwissenschaften Anatomie Biochemie Physiologie Chemie&Pharmazie Physik Kliniken Informatik Mikrosystemtechnik FDM molekular- organismische Forschungsbereiche molekulare & molekularbiologisch zellbiologische Forschungsbereiche klinische Forschungsbereiche Informatik Mikrosystemtechnik Datenanalyse ZBSA Zentrum für Biosytemanalyse Biotech-Park

10 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg ZBSA Baufertigstellung geplant Anfang 2005 Ca. 100 Mitarbeiter Ca. 3000 qm

11 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg Systems Biology Bioinformatik Modellbildung Sozial- bereich Labore S1 / S2: quantitative Datenerhebung ZBSA: Integration von Datenerhebung und Theorie OG1 OG2

12 Zentrum für Biosystemanalyse ZBSA Universität Freiburg