Interoperabilität und Standards am Beispiel des Specimen-Container-Modells für Strukturierte Pathologiebefunde G. Haroske, Dresden.

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1 Interoperabilität und Standards am Beispiel des Specimen-Container-Modells für Strukturierte Pathologiebefunde G. Haroske, Dresden

2 Herausforderung Motivation, Bereitschaft, Fähigkeit und Fertigkeit, zur Erreichung gemeinsamer Geschäftsziele zu kooperieren erfordert geteiltes, d.h. gemeinsam genutztes Wissen und Fertigkeiten unterschiedlichen Interoperabilitätsniveaus Wissen, Fähigkeiten und Fertigkeiten zur Sicherung der Interoperabilität dynamisch bereitstellen (Blobel 2014) G. Haroske TMF 2

3 Interoperabilität Interoperabilität ist die Fähigkeit von zwei oder mehr Systemen oder Komponenten Informationen auszutauschen und diese ausgetauschten Informationen zu nutzen (IEEE Standard Computer Dictionary: A Compilation) Interoperabilität ist die Fähigkeit von zwei Parteien, entweder Mensch oder Maschine, Daten oder Informationen auszutauschen, wobei dieser bestimmte Austausch die Bedeutung der geteilten Informationen bewahrt (HL7 SAIF) G. Haroske TMF

4 Interoperabilität Prozessinteroperabilität
technische Interoperabilität Prozessinteroperabilität syntaktische Interoperabilität semantische Interoperabilität Serviceinteroperabilität wissensbasierte Interoperabilität?? G. Haroske TMF

5 Vorteile von Standards
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6 Interoperabilität und Standards
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7 IHE, HL7 und CDA IHE „Integrating the Health Care Enterprise“
Integrationsprofile für vorhandene Standards HL7 „Health Level 7“ SDO & Standards CDA „Clinical Document Architecture“ Standard zur Strukturierung, zum Inhalt und zum Austausch medizinischer Dokumente (HL7v3 CDA R2) G. Haroske TMF

8 CDA seit 2005 ANSI Standard definiert Informationsobjekte (Text, Bilder, Töne, Biosignale etc.) syntaktische IOP durch XML semantische IOP durch RIM und HL7 Datentypen universell für Gesundheitswesen und medizinische Forschung G. Haroske TMF

9 Struktur und Syntax G. Haroske TMF

10 Szenario Pathologie untersucht eine Probe, die von einem Patienten gewonnen wurde Über die Untersuchung wird ein Befundbericht erstellt Befundbericht geht zurück an Einsender Befundbericht kann auch anderen Nutzern zur Verfügung gestellt werden G. Haroske TMF

11 Interoperabilität? Befundbericht besteht aus Header und (strukturiertem) Body im Body „Clinical Statements“, vor allem zu Prozeduren und Beobachtungen besteht dazu ein „shared knowledge“ ?? G. Haroske TMF

12 Reference Information Model
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13 Domain Analysis Model for Specimen and Container
“Specimen” is defined as a role played by a physical entity (one or more physical objects considered as single unit) when the entity is identified uniquely by the laboratory and is the direct subject of more steps in a laboratory (diagnostic) workflow. In most, but not all, process steps, specimens are held in containers, and a container often carries its specimen’s ID. DICOM Suppl. 122

14 Domaine Analysis Model for Specimen

15 Domaine Analysis Model
0 .. * Performer PerformedSpecimenCollection Subject results from used in Specimen SpecimenProcessingActivity results from is contained in SpecimenContainer Holder is described by SpecimenContainerParameters StorageEquipment HolderParameters

16 Domaine Analysis Model
0 .. * Performer PerformedSpecimenCollection Subject results from used in Specimen SpecimenProcessingActivity results from is contained in SpecimenContainer Holder is described by SpecimenContainerParameters StorageEquipment HolderParameters

17 Attribute für Specimen
Name Typ Definition specimenIdentifier Identifier The alphanumeric sequence that uniquely defines the specimen. parentIdentifier Sequence of characters, capable of uniquely identifying the specimen from which the current specimen was derived typeCode Code Coded representation of the precise nature of the entity that will be the source material for the observation. EXAMPLE(S): stool, tissue, blood, CSF handlingCode Coded representation of how the specimen and/or container needs to be handled from the time of collection through the initiation of testing. EXAMPLE(S): keep frozen isDerived Boolean A Boolean indicator to note that the current specimen is derived from another specimen specimenRole Coded representation of the purpose of the sample as related to the analytical procedure being performed. EXAMPLE(S): A reference sample, proficiency sample, QC sample, clinical sample

18 IHE APSR Evolution 2014 Specimen procedure step <entry>
Procedure Steps <section> 1..1 <code> 1..1 <title> human-readable content of the section 1..1 <text> 0..* Specimen procedure step <entry> One occurrence per primary specimen <procedure> 1..1 <code> Type of step 1..1 <effectiveTime> When 0..1 <targetSite> Anatomic site 0..1 <performer> Who 1..1 Specimen produced by the step <id> 0..1 Additional specimen information 0..1

19 IHE APSR Evolution 2014 Specimen produced by the step
specimen information <organizer> a specimen or group thereof 1..1 Specimen produced by the step part, block, slide, … specimenIdentifier <id> parentIdentifier<id> classCode typeCode subTypeCode isDerived specimenRole specimenChildRole specimenGroupCount Container parameters image(s), ROI(s), comment(s) related to the specimen

20 Fazit Interoperabilität ist nicht zuerst eine Sache der IKT-Domäne, sondern eine der Nutzer-Domäne. Interoperabilität ist eine Herausforderung zur Erfüllung der Geschäftsziele. Sie fordert das Teilen/gemeinsame Nutzen von Wissen, Fähigkeiten und Fertigkeiten, die auf einem hierarchischen System von Ontologien aufgebaut werden sollten. Multidisziplinäre Interoperabilitätslösungen (Lebenswissenschaften, Naturwissenschaften, Technologie, Rechts- und Sozialwissenschaften, etc.) erfordern einen systemtheoretischen, architekturzentrierten Ansatz, der die Formalisierung der Systemdarstellung einschl. Ontologie- Mapping ermöglicht. (Blobel 2014)