PG 487 Methoden der Computational Intelligence in der Bioinformatik

Präsentation zum Thema: "PG 487 Methoden der Computational Intelligence in der Bioinformatik"—  Präsentation transkript:

1 PG 487 Methoden der Computational Intelligence in der Bioinformatik
Thomas Bartz-Beielstein, Nicola Beume und Boris Naujoks Lehrstuhl für Algorithm Engineering und Systemanalyse (Ls11) Fachbereich Informatik Universität Dortmund

2 Computational Intelligence (CI)
Bioinformatik Biologie & Informatik & Mathematik & Statistik Erkenntnisse aus biologischen Daten gewinnen Riesige Datenmengen verwalten, strukturieren Analyse, Interpretation von Proteinen, Aminosäuren Evolutionäre Algorithmen Fuzzy Systeme Schwarm Intelligenz (Ameisen Kolonien, PSO) Künstliche Neuronale Netze Natur-inspirierte Verfahren Computational Intelligence (CI)

3 Unfairer Würfel im Casino
Ergebnissequenz: 1,6,3,6,5,3,5,3,5,6,2, Vermutung: fairer und unfairer Würfel im Gebrauch 2 Zustände (A, B) modelliert mit Hidden Markov Modellen (HMM)

4 Bioinformatik Proteinsequenz:
P,I,R,T,V,S,Q,L,T,R,E,I,Y,T,N,P,V,L,E,N,F,D,G,S,F Vermutung: 8 verschiedene Bereiche (Konfigurationen) 8 Zustände (A, B, …) modelliert mit Hidden Markov Modellen (HMM) Software:

5 Ablauf der PG Seminarphase (Bommerholz) Sequenzanalyse
HMM Topologieoptimierung Freie Themenwahl Ameisenalgorithmen Reale Anwendung von Zwischen- und Endbericht

6 Anforderungen an Teilnehmer
Motivation CI-Methoden Bioinformatik Objekt-orientierte Programmierung Wir bieten... Interdisziplinäre Arbeit an realen Problemen Verschiedene Aufgabengebiete Möglichkeit für Diplomarbeiten Kooperation mit der BioIndustry

7 Infoveranstaltung Dienstag, 6.12.2005 10:15 Uhr OH 16, R 205
Ausgabe von GÖBIX DVD Kontakt zu Ab nächste Woche im Neubau OH14 !