Digitalisierung historischer bioligischer Texte Ophrys muscifera

Präsentation zum Thema: "Digitalisierung historischer bioligischer Texte Ophrys muscifera"—  Präsentation transkript:

1 Digitalisierung historischer bioligischer Texte Ophrys muscifera
Aceras anthropophora aus: Thomé: Flora von Deutschland, Österreich und der Schweiz. 1888 Kurt Stüber Max-Planck-Institut für Züchtungsforschung Carl-von-Linné-Weg 10 D Köln

2 Warum: Schaffung einer elektronischen Bibliothek biologischer Bücher mit freiem Zugang zu allen Inhalten über das Internet.

3 Freier Zugang zu wertvollen
Lehrmaterialien einschließlich eines wissenschaftlichen Index.

4 in der Google Bildsuche:
Ein Test: Suche nach Ophrys muscifera in der Google Bildsuche: Bilder aus BioLib erscheinen in den Positionen 1, 6 und 8

5 Schritt 1 Einscannen: Kameras: CANON EOS D60 CANON EOS 350D

6 Schritt 1 Einscannen: Kameras: CANON EOS D60 CANON EOS 350D
D60 = 6 Megapixel 350D = 8,1 Megapixel Die Auflösung ist abhängig von der Größe des Originals: Bei DIN A4 sind es etwa 120 dpi.

7 Rotieren und Beschneiden:
Schritt 2 Rotieren und Beschneiden: Programm: Photoshop, action

8 Optimierung von Kontrast und Helligkeit:
Schritt 3 Optimierung von Kontrast und Helligkeit: Programm: Photoshop, action

9 Abspeichern in 3 Größen:
Schritt 4 Abspeichern in 3 Größen: Programm: Photoshop action

10 Schritt 4 Abspeichern in drei Größen: Originalgröße: 3000 x 2000 Pixel
Bildschirm: 1200 x 800 Pixel Vorschau: 200 x 140 Pixel

11 Schritt 5 Abspeichern der Metadaten in der Textdatei: author title
subtitle year town cover comment language text_image high high/IMG_0565.jpg screen screen/IMG_0565.jpg icon icon/IMG_0565.jpg high high/IMG_0611.jpg screen screen/IMG_0611.jpg icon icon/IMG_0611.jpg PERL-Programm: make_rsc.pl

12 Manuelle Eingabe der Metadaten:
Schritt 6 Manuelle Eingabe der Metadaten: author Ernst Weiss title Die Sigillarien der preussischen Steinkohlengebiete. subtitle Die Gruppe der Favularien year 1887 town Berlin cover cover.jpg comment Das Original des Werkes wurde freundlicherweise von Prof. Dr. Ruprecht Düll zur Verfügung gestellt. Einscannen und Bearbeitung durch Kurt Stüber, März 2004. language Deutsch text_image high high/IMG_0565.jpg screen screen/IMG_0565.jpg icon icon/IMG_0565.jpg high high/IMG_0611.jpg screen screen/IMG_0611.jpg icon icon/IMG_0611.jpg Manuell

13 Sortierung der Seiten in der Textdatei:
Schritt 7 Sortierung der Seiten in der Textdatei: author Ernst Weiss title Die Sigillarien der preussischen Steinkohlengebiete. subtitle Die Gruppe der Favularien year 1887 town Berlin cover cover.jpg comment Das Original des Werkes wurde freundlicherweise von Prof. Dr. Ruprecht Düll zur Verfügung gestellt. Einscannen und Bearbeitung durch Kurt Stüber, März 2004. language Deutsch text_image high high/IMG_0565.jpg screen screen/IMG_0565.jpg icon icon/IMG_0565.jpg high high/IMG_0611.jpg screen screen/IMG_0611.jpg icon icon/IMG_0611.jpg Programme: reorder_rsc.pl renumber_rsc_and_files.pl

14 Sortierung der Seiten in der Textdatei:
Schritt 7 Sortierung der Seiten in der Textdatei: title Zoologische Philosophie subtitle Mit Einleitung und einem Anhang: Das phylogenetische Systeml author Jean Lamarck year 1909 language German cover umschlag.jpg comment Buch eingescannt von Frank Al-Dabbagh, September 2002. text_image high high/IMG_5904.jpg screen screen/IMG_5904.jpg icon icon/IMG_5904.jpg high high/IMG_5905.jpg screen screen/IMG_5905.jpg icon icon/IMG_5905.jpg high high/IMG_5907.jpg screen screen/IMG_5907.jpg icon icon/IMG_5907.jpg high high/IMG_5908.jpg screen screen/IMG_5908.jpg icon icon/IMG_5908.jpg high high/IMG_5909.jpg screen screen/IMG_5909.jpg icon icon/IMG_5909.jpg high high/IMG_5910.jpg screen screen/IMG_5910.jpg icon icon/IMG_5910.jpg high high/IMG_5911.jpg screen screen/IMG_5911.jpg icon icon/IMG_5911.jpg high high/IMG_5912.jpg screen screen/IMG_5912.jpg icon icon/IMG_5912.jpg title Zoologische Philosophie subtitle Mit Einleitung und einem Anhang: Das phylogenetische Systeml author Jean Lamarck year 1909 language German cover umschlag.jpg comment Buch eingescannt von Frank Al-Dabbagh, September 2002. text_image high high/IMG_5904.jpg screen screen/IMG_5904.jpg icon icon/IMG_5904.jpg high high/IMG_7888.jpg screen screen/IMG_7888.jpg icon icon/IMG_7888.jpg high high/IMG_5905.jpg screen screen/IMG_5905.jpg icon icon/IMG_5905.jpg high high/IMG_7889.jpg screen screen/IMG_7889.jpg icon icon/IMG_7889.jpg high high/IMG_5907.jpg screen screen/IMG_5907.jpg icon icon/IMG_5907.jpg high high/IMG_7890.jpg screen screen/IMG_7890.jpg icon icon/IMG_7890.jpg high high/IMG_5908.jpg screen screen/IMG_5908.jpg icon icon/IMG_5908.jpg high high/IMG_7891.jpg screen screen/IMG_7891.jpg icon icon/IMG_7891.jpg high high/IMG_5909.jpg screen screen/IMG_5909.jpg icon icon/IMG_5909.jpg high high/IMG_5910.jpg screen screen/IMG_5910.jpg icon icon/IMG_5910.jpg high high/IMG_5911.jpg screen screen/IMG_5911.jpg icon icon/IMG_5911.jpg high high/IMG_5912.jpg screen screen/IMG_5912.jpg icon icon/IMG_5912.jpg Dies ist erforderlich, weil die Seiten nicht immer in der korrekten Reihenfolge gescannt werden können

15 Schritt 8 OCR der Textseiten: Programme: ABBYY-Finereader
Omnipage prof.

16 Schritt 9 Eingabe biologisch relevanter Schlüsselwörter: text_image
high high/CRW_7164_RT8.jpg screen screen/CRW_7164_RT8.jpg icon icon/CRW_7164_RT8.jpg key Ophrys muscifera; Aceras anthropophora high high/CRW_7165_RT8.jpg screen screen/CRW_7165_RT8.jpg icon icon/CRW_7165_RT8.jpg key Corvus dauricus; Monedula dauricus high high/CRW_7166_RT8.jpg screen screen/CRW_7166_RT8.jpg icon icon/CRW_7166_RT8.jpg key Corvus cyanus; Pica cyanus high high/CRW_7167_RT8.jpg screen screen/CRW_7167_RT8.jpg Manuell und über Datenbankverbindung zu

17 Schritt 9 Eingabe biologisch relevanter Schlüsselwörter:
pcks03> perl wsdl_oo.pl Give species name: Ophrys muscifera Flugblomster (Swedish) Give species name: Aceras anthorpophora Green man orchid (English) Hanged-man orchid (English) Datenbankverbindung zu Problem: Die erhaltenen Daten sind fragmentarisch und nicht vollständig.

18 Schritt 10 Erstellung der Webseiten: PERL-Programm: make_book.pl

19 Erstellung der PDF-Seiten:
Schritt 11 Erstellung der PDF-Seiten: Programm: make_book_04.pl

20 Erstellung von CDs und DVDs:
Schritt 12 Erstellung von CDs und DVDs: Programme: CorelDraw (Titelblatt) Adobe Illustrator(Titelblatt)

21 Schritt 13 Sachgebiete: Automatische Erstellung
Anatomie [4] Anthropologie [2] Astronomie [1] Autobiographie [5] Biologie [1] Botanik [104] Embryologie [2] Evolution [31] Flechten [1] Gartenbau [1] Genetik [19] Geologie [14] Insekten [10] Landwirtschaft [9] Lebensmittelkunde [1] Medizin [1] Mikrobiologie [1] Mikroskopie [18] Moose [1] Ökologie [4] Orchideen [1] Paläontologie [10] Pflanzenanatomie [14] Pflanzengeographie [2] Pflanzenökologie [2] Pflanzenphysiologie [5] Physik [1] Physiologie [2] Phytopathologie [6] Pilze [8] Politik [4] Primaten [8] Reisebericht [26] Säugetiere [15] Systematik [82] Theologie [1] Verhaltensforschung [1] Vögel [1] Zoologie [38] Automatische Erstellung von Indexseiten für BioLib, sortiert nach Autoren, Jahren, Sachgebieten und Titeln. PERL-Programm: make_library.pl

22 Schritt 14 Erstellung von Standardindices im MARC-Format zum
Datenaustausch mit anderen Bibliotheken: PERL-Programm: make_marc.pl

23 Schritt 15 Erstellung von Standardindices im XML-Format zum Austausch
mit anderen Bibliotheken: PERL-Programm: make_xml.pl

24 Index der Autoren: Ach, Johann Frantz Griendel [1] Allmers, Hermann [1] Andersson, Nils Johan [1] Auersperg, Johann von [1] Backhouse, James [1] Baer, Karl Ernst von [2] Baker, Heinrich [1] Bary, Anton de [1] Bateson, William [1] Batsch, August Johann Georg Karl [3] Baur, Erwin [1] Belar, Karl [1] Berger, Alwin [1] Beringer, Johannes Bartholomäus Adam [1] Bley, Franz [1] Bolleter, Eugen [1] Boltshauser, Heinrich [4] Brandis, Dietrich [1] Breidler, Johann [1] Bretschneider, Emil Vasilievitch [2] Buffon, Georges Louis LeClerc de [15] Busch, Johann Georg [1] Cammerloher, Hermann [1] Correns, Carl [1] Cuvier, Georg [1] Dammer, Udo [3] Darwin, Charles [18] Dauxion-Lavayssé, Jean François [1] Dippel, Leopold [5] Eberhard, Johann Peter [1] Ecluse, Charles de L' [1] Ehrmann, Johann Christian [1] Eichelberg, Johann Friedrich Andreas [1] FitzSimons, Frederik William [1] Flinders, Matthew [1] Frey, Heinrich [1] Fruwirth, Karl [5] Fuchs, Leonhart [1] Geheeb, Adalbert [1] Gentil de la Galaziere, Guillaume Baptiste Le [2] Gesner, Conrad [1] Gilg, Ernst [1] Goette, Alexander [2] Haeckel, Ernst [33] Haller, Albert [1] Hallier, Ernst [3] Hannover, Adolph [1] Hartig, Robert [1] Hertwig, Oscar [2] Hildebrand, Friedrich [1] Hoernes, Moritz [1] Holtermann, Carl [2] Humboldt, Alexander von [5] Ingen-Houß, Johann [1] Jacquin, Nikolaus Joseph von [4] Jenners, Edward [1] Jüngst, Hugo C. [1] Kaiser, Wilhelm [1] Kerner von Marilaun, Anton Josef [1] Keyserling, Alexander [1] Kirchner, Oskar von [4] Klebs, Georg [3] Klein, Ludwig [2] Köhler, Franz Eugen [1] Königsbrunn, Hermann von [1] Kotschy, Theodor [1] Kotze, Stefan von [1] Krabbe, Gustav Heinrich [1] Kühn, Alfred [1] Lamarck, Jean [1] Ledermüller, Martin Frobenius [1] Lindau, Gustav [4] Lindman, Carl Axel Magnus [1] Malpighi, Marcello [3] Mappus, Marcus [1] Martiny, Benno [1] Masters, Maxwell Tylden [1] Medicus, Friedrich Kasimir [1] Mendel, Gregor [1] Menzel, Wolfgang [3] Merkel, Friedrich [1] Merz, Ludwig [1] Meyen, Franz Julius Ferdinand [1] Mohl, Hugo von [1] Müller:, Hermann [1] Nägeli, Carl [1] Olbers Focke, Wilhelm [1] Oltmanns, Friedrich [2] Orbrigny, Alcide d' [1] Pallas, Peter Simon [2] Pappe, Karl Wilhelm Ludwig [1] Petri, Richard Julius [1] Pfeffer, Wilhelm Friedrich Philipp [1] Pohl, Johann Baptist Emanuel [2] Potonié, Henry [1] Ranke, Johannes [1] Reitter, Edmund [5] Ricken, Adalbert [1] Ross, Hans [2] Roßmäßler, Emil Adolph [1] Ruppe, Heinrich Bernhard [1] Salm-Reifferscheid-Dyck, Josef [1] Scheuchzer, Johann Jakob [2] Schiede, Christian Julius Wilhelm [1] Schilsky, Julius [1] Schimper, Andreas Franz Wilhelm [3] Schinz, Salomon [1] Schleiden, Matthias Jakob [3] Schrank, Franz von Paula [2] Schreber, Johann Christian Daniel von [1] Schubert, Gotthilf Heinrich von [1] Schultz, Hermann [1] Schulze, Christian Friedrich [1] Schulze, Max [1] Schumann, Karl [1] Schwarz, Frank [1] Schwendener, Simon [2] Semon, Richard [1] Siebold, Philipp Franz von [4] Strasburger, Eduard [3] Stüber, Kurt [3] Taschenberg, Ernst Ludwig [1] Taubert, Paul Hermann Wilhelm [1] Thomé, Otto Wilhelm [2] Valentin, Gabriel Gustav [1] Virchow, Rudolf [3] Vöchting, Hermann [1] Wanke, Dierk [2] Wegener, Alfred [1] Weismann, August [1] Weiss, Ernst [1] Weizenbeck, Georg Anton [1] West, George Stephen [4] West, William [4] Wettstein, Richard [1] Willdenow, Karl Ludwig [2] Willkomm, Moritz [1] Wohltmann, Ferdinand Friedrich Wilhelm [1] Yokoyama, Charai [1] Zappa [1] Zuccarini, Joseph Gerhard [3]

25 Index aller botanischen Abbildungen:

26 Index aller zoologischen Abbildungen:

27 1 Stunde Arbeitszeit für circa 100 Seiten (einschließlich Einscannen,
Zeitbedarf: 1 Stunde Arbeitszeit für circa 100 Seiten (einschließlich Einscannen, Eingabe vom Metadaten, OCR, und Erstellung der Webseiten) OCR ohne manuelle Korrektur

28 Statistik: Werte vom 19 November, 2008 255 Autoren 477 Bücher gescannte Seiten aus 40 Sachgebieten der Biologie aus dem Jahre 1545 bis heute.

29 Serverstatistik: Tägliche Zugriffe auf www.BioLib.de
ohne Zugrifffe auf gespiegelte Seiten. Programm: awstats

30 Geplante Erweiterungen:
Speicherung aller Metadaten in einer SQL Datenbank: Vorteile: Ermöglicht intelligente Suchabfragen. Ermöglicht alternative Darstellungen. Ermöglicht mehrsprachige Oberflächen. Ermöglicht interaktives Arbeiten der Editoren. Ermöglicht Erstellung aktiver Links zu anderen biologischen Datenbanken. Nachteil: Kein Offline-Zugriff möglich. Programm: add_data_to_db.pl

31 Geplante Erweiterungen
Speicherung aller Metadaten in einer SQL Datenbank: Webinterface: phpmyadmin