Pfad Akt.Nr.: xxxx/xxxxx/xxxx Analyse Medizinischer Freitexte Lukas Faulstich, ID GmbH & Co. KGaA Projekttreffen ByMedConnect | München, 12.03.2010.

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1 Pfad Akt.Nr.: xxxx/xxxxx/xxxx Analyse Medizinischer Freitexte Lukas Faulstich, ID GmbH & Co. KGaA Projekttreffen ByMedConnect | München, 12.03.2010

2 Übersicht Motivation: Einsatzszenarien der medizinischen Informationsextraktion Herausforderungen bei der Analyse medizinischer Freitexte Lösungen: IE-Tool / Web-Komponenten / ID Logik Word- AddIn Zusammenfassung Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 1

3 Einsatzszenarien der medizinischen Informationsextraktion Ziel: Inhaltliche Erschließung von medizinischen Dokumenten (z.B. Befunden, Arztbriefen) Anwendungsmöglichkeiten: Recherche  semantisches Retrieval Codierung  Erkennung von abrechnungsrelevanten Diagnosen / Prozeduren / Medikationen Plausibilisierung  Abgleich mit vorhandener Codierung  Arzneimitteltherapiesicherheit Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 2

4 Herausforderungen bei der inhaltlichen Erschließung vielfältige Formulierungsvarianten teilweise mangelhafte Textqualität Formeln negierte Aussagen semantische Beziehungen irrelevante Informationen (anwendungsabhängig) Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 3

5 Linguistische Varianz in med. Freitexten Beispiel: Gastritis Synomyme: Magenschleimhautenzündung Unterbegriffe: akute G~, chronische G~, Refluxgastritis, Ménétrier(-Syndrom)... Akronyme: DG (diffuse Gastritis) Verkürzungen: gastr, gastr. Schreibfehler: Gastirtis, Zeichensetzung Getrennt- / Zusammenschreibung: Entzündung der Magenschleimhaut dt. / lat. Schreibweise: Kolon, Colon Groß-/Kleinschreibung: im = IM = Innenmeniskus? Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 4

6 Lösung: IE-Tool linguistische Textaufbereitung Verschlagwortung mit Konzepten (Indizes) der Wingert- Nomenklatur semantische Repräsentation Verknüpfung der semantischen Repräsentation mit ID MACS ® – medical semantic network – (MSN) Visualisierung Beispielapplikationen (Retrieval, Codierung) Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 5

7 Textaufbereitungs-Pipeline Un- strukturierter Text Gliederung Satz- segmentierung Parsen / Floskeln erkennen Segment- ierung Abk.- Exp. semant. Beziehungen Extraktion Indexierung Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 6

8 IETool: Visualisierung Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 7

9 IETool: Codierung von Medikationen Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 8

10 Arzneimitteltherapiesicherheit: Web-Portal ID PHARMA CHECK ® Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 9

11 Lösung: ID Logik WordAddIn Medizinische Text-Retrieval-Systeme | Folie 10

12 Fazit Freitextanalyse medizinischer Dokumente verspricht attraktive Anwendungen für Retrieval, Codierung, Plausibilisierung u.a.m. heuristische Verfahren sind fehlerbehaftet  vollautomatische Anwendungen weniger sinnvoll  interaktive Anwendungen vorzuziehen ID LOGIK ® Terminologieserver bietet verschiedene Dienste zur Informationsextraktion Einbindung dieser Dienste z.B. im Word-AddIn Web Components bündeln Dienste für bestimmte Anwendungen Analyse Medizinischer Freitexte | Lukas Faulstich | 12.03.10 | Folie 11

13 Pfad Akt.Nr.: xxxx/xxxxx/xxxx Vielen Dank für Ihre Aufmerksamkeit !