Struktur-Funktions-Modelle von Pflanzen

Präsentation zum Thema: "Struktur-Funktions-Modelle von Pflanzen"—  Präsentation transkript:

1 Struktur-Funktions-Modelle von Pflanzen
- Sommersemester Winfried Kurth Universität Göttingen, Lehrstuhl Computergrafik und Ökologische Informatik 10. Vorlesung:

2 zuletzt: Darstellung von Graphen in XL transitive Hülle
Graphansicht in GroIMP, Graph-Layouts Queries im Graphen Die Software GroIMP (Übersicht)

3 als nächstes: sequenzieller und paralleler Ableitungsmodus in XL
noch ein neuer Regeltyp: Instanzierungsregeln Beispiel für ein einfaches „reines Strukturmodell“ einer Pflanze (Gänseblümchen)

4 Ableitungsmodi in XL standardmäßig voreingestellt: parallele Regelanwendung (wie bei L-Systemen) Umschalten auf sequenzielle Anwendung (in jedem Schritt wird dann höchstens eine Regel angewandt): setDerivationMode(SEQUENTIAL_MODE) Rückschaltung auf parallel: setDerivationMode(PARALLEL_MODE) testen Sie das Beispiel sm09_b32.rgg

5 Ein weiterer Regeltyp in XL: Instanzierungsregeln
Zweck: Ersetzung einzelner Module durch kompliziertere Strukturen, nur für die Darstellung (wie bei Interpretationsregeln) aber: es wird weniger abgespeichert (Einsparen von Speicherplatz) anders als bei Interpretationsregeln dürfen keine Turtle- Befehle mit Wirkung auf andere Knoten verwendet werden weitere Möglichkeit: „Replikator-Knoten“ zum Kopieren und Neuplatzieren von ganzen Strukturen

6 Instanzierungsregeln: Syntax
kein neuer Regelpfeil Angabe der Instanzierungsregel direkt in der Moduldeklaration module A ==> B C D; ersetzt (instanziert) überall A durch B C D Beispiel sm09_b43.rgg

7 const int multiply = EDGE_0; /* selbstdefinierter Kantentyp */
module Tree ==> F(20, 1) [ M(-8) RU(45) F(6, 0.8) Sphere(1) ] [ M(-5) RU(-45) F(4, 0.6) Sphere(1) ] Sphere(2); module Replicator ==> [ getFirst(multiply) ] Translate(10, 0, 0) [ getFirst(multiply) ]; public void run1() [ Axiom ==> F(2, 6) P(10) Tree; ] public void run2() Axiom ==> F(2, 6) P(10) Replicator -multiply-> Tree; Tree wird mit der roten Struktur instanziert es wird eingefügt, was an der „multiply“-Kante hängt

8 weiteres Beispiel einer Anwendung eines Multiplikator-Knotens mit Instanzierungsregel:
(Henke 2006)

9 Beispiel eines reinen Strukturmodells (ohne Entwicklung) für eine „einfache“ Pflanze: das Gänseblümchen (Bellis perennis) (nach K. Smoleňová und R. Hemmerling) Hier behandelte Schritte: - Datensammlung - Aufbau der Topologie der Pflanze im Modell - Texturierung - weitere Verbesserungen

10

11 Ergebnisse der Datensammlung und der Wissens-Recherche über die Pflanze:
- kleine, runde oder löffelartige, immergrüne Blätter, 2 bis 5 cm lang, nah dem Boden als Rosette angeordnet - blattloser Stamm, 2 bis 10 cm lang - grüne Kelchblätter in zwei Zeilen, gewöhnlich 13 Stück - kegelförmige Blütenbasis, 6 mm lang, 5 mm Durchmesser - Korbblüte mit weißen Blütenblättern (Zungenblüten), 11 mm lang, 2 mm breit - kleine gelbe Röhrenblüten ( ) im Inneren des Blütenstandes - kleines, vertikales Rhizom mit faserigen Wurzeln

12 Definition der (vereinfachten) Bestandteile der Pflanze für das Modell (beschränkt auf den oberirdischen Teil): Ergänzen der entsprechenden Parameter dieser Module:

13 Zuordung einer Form zu einem Modul
Zwei Möglichkeiten: - Vererbung von einem (vordefinierten) Geometrieobjekt - Verwendung einer Instanzierungsregel

14 Erzeugung der Blätter nahe dem Boden:

15 Erzeugung des Stammes:
Erzeugung der Kelchblätter des Blütenstandes:

16 Erzeugung der Blütenbasis (= Blütenstandsboden):
Erzeugung der weißen Zungenblüten:

17 Erzeugung der gelben Röhrenblüten:
Ergebnis bisher:

18 Verbesserung des visuellen Realismus durch Texturen
(Quellen: Digitalkamera, Scanner, existierende Fotos aus dem Web oder aus botanischen Lehrbüchern) Vorverarbeitung der Texturen: - Anpassen der Helligkeit - Ausschneiden, den Hintergrund transparent machen - Größenanpassung (Vermeidung zu speicherplatzintensiver Texturen) Beispiele für vorbereitete Gänseblümchen-Texturen:

19 Interaktiver Import der Texturen nach GroIMP
(vgl. Kapitel 5)

20 Anwendung der Texturen auf ein Objekt (hier: ein Blatt):
(“leaf“ ist ein Standardmodul mit rechteckiger Geometrie) Ergebnis nach Texturierung:

21 Anpassen von Parametern und Einbau von Variabilität
nächste Schritte: Anpassen von Parametern und Einbau von Variabilität (in der Regel ein aufwändiger Prozess!) realistischerer Eindruck von der Pflanze durch Einbeziehen von Zufallsvariablen bei Festlegung der Maße Analyse der Modellergebnisse und anschließende Anpassung an die Daten von realen Pflanzen, bis das Modell „stimmt“ statistische Analyse der Daten von realen Pflanzen (Mittelwerte, Varianzen) und Verwendung der Ergebnisse für stochastische Parameter im Modell

22 Ergebnis mit Zufallsvariationen:

23 Mängel: Das Gänseblümchen-Modell ist ein reines Strukturmodell, also ohne Prozesse wie Photosynthese, Atmung, Wachstum etc., es beinhaltet keine Entwicklung (Wachstum, Erzeugung der Organe, Seneszenz...) Nächster Schritt ist somit: Entwicklung eines einfachen Funktions-Struktur-Modells (FSPM) mit Regeln, die die Ontogenese der Pflanze beschreiben