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PG 487 Methoden der Computational Intelligence in der Bioinformatik Thomas Bartz-Beielstein, Nicola Beume und Boris Naujoks Thomas Bartz-Beielstein, Nicola.

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Präsentation zum Thema: "PG 487 Methoden der Computational Intelligence in der Bioinformatik Thomas Bartz-Beielstein, Nicola Beume und Boris Naujoks Thomas Bartz-Beielstein, Nicola."—  Präsentation transkript:

1 PG 487 Methoden der Computational Intelligence in der Bioinformatik Thomas Bartz-Beielstein, Nicola Beume und Boris Naujoks Thomas Bartz-Beielstein, Nicola Beume und Boris Naujoks Lehrstuhl für Algorithm Engineering und Systemanalyse (Ls11) Fachbereich Informatik Universität Dortmund

2 Lehrstuhl für Algorithm Engineering und Systemanalyse (Ls11) ( 2 / 7 ) Biologie & Informatik & Mathematik & Statistik Erkenntnisse aus biologischen Daten gewinnen Riesige Datenmengen verwalten, strukturieren Analyse, Interpretation von Proteinen, Aminosäuren Evolutionäre Algorithmen Fuzzy Systeme Schwarm Intelligenz (Ameisen Kolonien, PSO) Künstliche Neuronale Netze Natur-inspirierte Verfahren Biologie & Informatik & Mathematik & Statistik Erkenntnisse aus biologischen Daten gewinnen Riesige Datenmengen verwalten, strukturieren Analyse, Interpretation von Proteinen, Aminosäuren Evolutionäre Algorithmen Fuzzy Systeme Schwarm Intelligenz (Ameisen Kolonien, PSO) Künstliche Neuronale Netze Natur-inspirierte Verfahren Bioinformatik Computational Intelligence (CI)

3 Lehrstuhl für Algorithm Engineering und Systemanalyse (Ls11) ( 3 / 7 ) Unfairer Würfel im Casino Ergebnissequenz: 1,6,3,6,5,3,5,3,5,6,2, Vermutung: fairer und unfairer Würfel im Gebrauch 2 Zustände (A, B) modelliert mit Hidden Markov Modellen (HMM)

4 Lehrstuhl für Algorithm Engineering und Systemanalyse (Ls11) ( 4 / 7 ) Bioinformatik Proteinsequenz: P,I,R,T,V,S,Q,L,T,R,E,I,Y,T,N,P,V,L,E,N,F,D,G,S,F Vermutung: 8 verschiedene Bereiche (Konfigurationen) 8 Zustände (A, B, …) modelliert mit Hidden Markov Modellen (HMM) Software:

5 Lehrstuhl für Algorithm Engineering und Systemanalyse (Ls11) ( 5 / 7 ) Ablauf der PG Seminarphase (Bommerholz) Sequenzanalyse HMM Topologieoptimierung Freie Themenwahl -Ameisenalgorithmen -Reale Anwendung von Zwischen- und Endbericht

6 Lehrstuhl für Algorithm Engineering und Systemanalyse (Ls11) ( 6 / 7 ) Anforderungen an Teilnehmer Motivation CI-Methoden Bioinformatik Objekt-orientierte Programmierung Wir bieten... Interdisziplinäre Arbeit an realen Problemen Verschiedene Aufgabengebiete Möglichkeit für Diplomarbeiten Kooperation mit der BioIndustry

7 Lehrstuhl für Algorithm Engineering und Systemanalyse (Ls11) ( 7 / 7 ) Infoveranstaltung Dienstag, :15 Uhr OH 16, R 205 Ausgabe von GÖBIX DVD Kontakt zu Ab nächste Woche im Neubau OH14 !


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